Molekulare Mechanismen der aktiven Demethylierung (A04)

• Fachliche Zuordnung: Biologische und Biomimetische Chemie
• Förderung: Förderung seit 2018
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 325871075

Seit 2009 sind drei neue DNA-Basen (5-Hydroxymethyl-, 5-Formyl- und 5-Carboxy-Cytidin, hmdC, fdC und cadC) gefunden worden. Diese Basen kommen vor allem in der DNA vor, welche aus Stammzellen und Neuronen isoliert wurde. Wir glauben, dass fdC und cadC Deformylierungs- und Decarboxylierungsreaktionen eingehen, was einen neuen, lange gesuchten, Weg zur aktiven Demethylierung etablieren würde. Mit diesem Projekt planen wir direkten Einblick zu gewinnen, ob eine solche Decarboxylierungsreaktion in Stammzellen tatsächlich auftritt. Wir möchten die ersten Schritte unternehmen um die decarboxylierende Entität in Stammzellen aufzuklären, welche für die Reaktion verantwortlich ist. Im zweiten Teil des Projektes planen wir die Entwicklung neuer, robuster Sequenziermethoden, die es uns erlauben werden, die Positionen von hmdC und fdC im Genom zu bestimmen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1309: Chemische Biologie epigenetischer Modifikationen
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Thomas Carell