Vorhersage von Akklimatisationsmodulatoren und Integratoren auf Basis von Omics-Daten (D02)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung seit 2016
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 270050988

Zur Identifikation von Akklimatisationsmodulatoren und -integratoren können die jeweiligen molekularen und bio-chemischen regulatorischen Eigenschaften sowie ihre Position innerhalb reaktionsspezifischer Netzwerke ausgenutzt werden. Unser Ansatz basiert auf dem Training individueller Modelle und kombiniert Transfer- und Meta-Learning für verschiedene regulatorische Eigenschaften. Dabei werden vorhandene, nicht anpassungsspezifische Datensätze mit spezifischen Datensätzen für das Vor-Training der Modelle genutzt, um die Herausforderungen der Datenknappheit zu überwinden. Das so entstehende Ensemble-Modell wird die Vorhersagenzuverlässigkeit entscheidend verbessern.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 175: Der Chloroplast als zentraler Knotenpunkt der Akklimatisation bei Pflanzen
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Timo Mühlhaus