Modellierung, Verständnis und Vorhersage von >2 Millionen Arabidopsis-Proteoformen im postgenomischen Zeitalter (D01)

• Fachliche Zuordnung: Genetik und Genomik der Pflanzen ; Biochemie und Biophysik der Pflanzen ; Bioinformatik und Theoretische Biologie ; Strukturbiologie
• Förderung: Förderung seit 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 514901783

D01 modelliert Arabidopsis-Proteoformen auf proteomweiter Ebene. Angesichts begrenzter Proteinstrukturen verknüpft das Projekt genomische Daten aus SNPstar mit Struktur- und Funktionsvorhersagen. Diese Initiative schafft eine entscheidende strukturelle Bioinformatik-Ressource, einen umfassenden Atlas für nsSNP-Effekte in Arabidopsis. Diese Ressource erleichtert die Erforschung genetischer Variationen und ihrer phänotypischen Auswirkungen, wovon mehrere CRC-Projekte profitieren. Sie bildet zudem die Grundlage für die Verbesserung von Pflanzenproteinen in nachfolgenden Förderperioden.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1664: Diversität pflanzlicher Proteoformen - SNP2Prot
• Antragstellende Institution: Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Panagiotis L. Kastritis; Dr. Georg Künze