Structural Dependence of the NH-Exchange Using Ubiquitin as an Example (A02)

• Subject Area: Structural Biology
• Term: from 2002 to 2012
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5485142

Der NH-Austausch in Proteinen ist ein punktgenauer Indikator für die Erreichbarkeit der NH-Gruppen für Wasser und somit insgesamt für die Faltungseigenschaften von Proteinen. Mit einem theoretischen Modell und experimentellen Messungen nach einer von uns entwickelten neuen Methode konnten wir zeigen, dass die Austauschraten am humanen Ubiquitin quantitativ vorausgesagt werden können. In diesem Projekt sollen unsere Erkenntnisse zunächst durch Messungen an drei Punkt-Mutanten ausgeweitet werden. Nach dem Studium dieser Punktmutationen sollen Ubiquitin-Komplexe mit Ligasen und ubiquitinylierte Ubiquitine untersucht werden.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 610: Variation in Protein Conformation: Cellbiological and Pathological Relevance
• Applicant Institution: Universität Leipzig
• Project Head: Professor Dr. Stefan Berger (†)