Vorkommen und Expression multipler sequenzheterogener ribosomaler Ribonukleinsäuregene in Bakterien

• Antragsteller: Professor Dr. Horst Backhaus
• Fachliche Zuordnung: Mikrobiologie, Virologie und Immunologie
• Förderung: Förderung von 1996 bis 2001
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5285444

Zum Abschluß des Projektes werden die Ergebnisse der Projektpartner zusammengeführt, indem die Genvarianten der 16S rDNA und der 23S rDNA zu Operonen in Paenibacillus polymyxa zugeordnet werden. Ein methodisch neuer Ansatz zur Bestimmung der Operonzahl wird durchgeführt. Die Aufklärung der Verteilung von Heterogenitäten in diesem Bakterienstamm wird mit der zusätzlichen Sequenzierung weiter 16S rDNA-Klone vervollständigt. Zusätzliche Primerpaare zur Detektion von Sequenzheterognetitäten in Abschnitten der 16S rDNA Sequenz werden etabliert und für die verbesserte Analyse des Auftretens und der Lokalisierung in der Gattung Paenibacillus und in weiteren bisher als Vertreter mit Sequenzheterogenitäten identifizierten Bakterien eingesetzt. Weitere Sequenzierungen klären die Sequenzheterognetität in der 16S rDNA bei anderen Arten im Vergleich mit den bei Paenibacillus polymyxa enthaltenen Ergebnissen. - Die Ergebnisse der cDNA-Analyse, mit den deutlichen Hinweisen auf fehlende Expression zweier Sequenzvarianten in P. Polymyxa werden methodisch unabhängig durch Sondenhybridisierung überprüft. Schließlich wird mit der im Projekt etablierten Methodik die Expression von Genvarianten in einem Bakterium untersucht bei dem es starke Hinweise auf differentielle Genexpression der 16S RNA-Gene gibt.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen