UHPLC-gekoppeltes Tandem-Quadrupol-Massenspektrometer für Multiple Reaction Monitoring-Messungen

• Fachliche Zuordnung: Pflanzenwissenschaften
• Förderung: Förderung in 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 526244010

Am Fachbereich Biologie der Universität Hamburg wird ein UHPLC-gekoppeltes Tandem-Quadrupol-Massenspektrometer für Multiple Reaction Monitoring-Messungen zur sensitiven und hochselektiven Quantifizierung definierter Verbindungen aus unterschiedlichen biochemischen Matrices etabliert. Um die Komplexität der Probe vor ihrem Eintritt in das Massenspektrometer (MS) zu reduzieren und ein breites Spektrum an Analyten mit einer hohen chemischen Vielfalt abzudecken, wird eine Flüssigkeitschromatographie-Kopplung vor der MS verwendet. Eine wichtige Anwendung wird die Analyse der Rolle von Pflanzen-Mikroben- sowie Algen-Mikroben-Interaktionen beim Umsatz organischer Substanz sein. Eine zu untersuchende Hauptmatrix ist die Rhizosphäre, wo komplexe Interaktionen zwischen Pflanzenwurzeln und Mikroben zur Umwandlung und zum Abbau organischer Substanz beitragen. Rhizosphären werden in Küstenökosystemen, gemäßigten Wäldern und Feuchtgebieten untersucht. Die Rolle von Phytoplankton-Exsudaten und Phytoplankton-Mikroben-Interaktionen werden in marinen Umgebungen untersucht. Darüber hinaus werden der Kohlenhydratumsatz in Pflanzenstreu und Schlüsselmetabolite in Biofilmen untersucht. Neben diesen Projekten, die sich auf Kohlenstoffflüsse konzentrieren, wird das Instrument auch in einer Vielzahl anderer Anwendungen eingesetzt, z.B. für die Analyse des Cardenolid-Gehalts in hochspezialisierten pflanzenfressenden Insekten, für die Quantifizierung von Zwischenprodukten des TCA-Zyklus in C. elegans, für die Quantifizierung von Steroidhormontitern beim Menschen und für die Quantifizierung von Zielmetaboliten in Fischembryonen. Das Instrument in die Technologieplattform Massenspektrometrie der Universität Hamburg und des Universitätsklinikums Hamburg-Eppendorf integriert. Gerätespezifische Standard-Arbeitsanweisungen werden erarbeitet und allen Benutzern zur Verfügung gestellt. Der Zugriff auf das Instrument wird über Benutzerregeln der Technologieplattform geregelt, die interne Benutzer gegenüber externen akademischen Benutzern gegenüber anderen externen Benutzern priorisieren. Die zentrale Facility-Management-Software hilft bei der Planung von Messzeiten. Die Daten werden während der Messung lokal gespeichert und direkt auf eine zweite Festplatte im Steuerungsrechner des Instruments gespiegelt. Für die dauerhafte Datenspeicherung werden Serverkapazitäten durch das Regionale Rechenzentrum der Universität Hamburg bereitgestellt.

• DFG-Verfahren: Forschungsgroßgeräte
• Großgeräte: UHPLC-gekoppeltes Tandem-Quadrupol-Massenspektrometer für Multiple Reaction Monitoring-Messungen
• Gerätegruppe: 1700 Massenspektrometer
• Antragstellende Institution: Universität Hamburg
• Leiter: Professor Dr. Kai Jensen