Untersuchungen des Gruppe I Introns CdtcdA und seiner Bedeutung für die Evolution von C. difficile Genen

• Applicant: Professor Dr. Christoph von Eichel-Streiber
• Subject Area: Parasitology and Biology of Tropical Infectious Disease Pathogens
• Term: from 1999 to 2009
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5229654

CdtcdA ist ein neuartiges Intron, das in Clostridium difficile in genomische offene Leseraster integriert. Unsere Daten lassen darauf schließen, daß CdtcdA eine Chimäre aus einem verkürzten Gruppe I Intron und einem deletierten Insertionselement der IS605 Familie ist. Durch Rekonstruktion eines funktionellen Gruppe I Introns und des IS-Elements läßt sich diese Hypothese verifizieren. Die Expression der beiden offenen Leseraster tlpA und tlpB in E. coli wird Basis für die Untersuchung der Bedeutung dieser Proteine für die Mobilität des Introns sein. Die Kopienzahl von CdtcdA in C. difficile Genomen variiert. Unterschiede der Intronsequenzen und Variationen ihrer Integrationsstellen sollen untersucht werden. Auf diesem Weg identifizierte Konsensussequenzen erlauben die Bestimmung von Zielstrukturen für die Integration von CdtcdA. Das bei CdtcdA erstmals beobachtete inverse Spleißen generiert alternative mRNA-Spezies. Durch Konstruktion von Mutanten CdtcdA Introns sollen die verantwortlichen Strukturen und der Ablauf des inversen Spleißens untersucht werden. Die infolge des unkonventionellen Spleißens generierten "atypische mRNA-Spezies", können zur Expression neuartiger Fusionsproteine führen. Der Einsatz spezieller Reporterkonstrukte als Modellsystem soll die Bedeutung des unkonventionellen Spleißens für die Evolution von C. difficile Proteinen klären.

• DFG Programme: Research Grants