Von einer 2D-Proteindatenbank zu einer "Response Regulation Map" der stationären Phase von Bacillus subtilis (adaptives Netzwerk)

• Antragsteller: Professor Dr. Michael Hecker
• Fachliche Zuordnung: Stoffwechselphysiologie, Biochemie und Genetik der Mikroorganismen
• Förderung: Förderung von 1998 bis 2007
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5119040

In unserer Arbeitsgruppe ist z.Zt. das internationale Referenzlabor für Proteomics von Bacillus subtilis angesiedelt. Die weltweit einzige Proteom-Datenbank Gram-positiver Bakterien Sub-2D (http://microbio2.biologie.uni-greifswald.de:8880/sub2d.htm), auf die täglich aus verschiedensten Laboratorien der Welt zugegriffen wird, wurde in unserem Labor erstellt und wird ständig ergänzt. Unser Forschungsschwerpunkt liegt eindeutig in der 'physiologischen Proteomics', d.h. in dem Bemühen, mit Hilfe der Proteomics zu neuen Erkenntnissen über die Bakterienphysiologie ganz allgemein zu gelangen. Dabei geht es nicht nur um die Analyse der Basismodule globaler Genregulation (Stimulons, Regulons, Modulons, regulatorische Netzwerke), sondern auch um die Voraussage der Funktion bisher unbekannter Proteine. Im Rahmen des DFG-Projektes He 1887/6-1 wird dieser Ansatz zur Beschreibung der Regulation, Struktur und Funktion bekannter sowie unbekannter Regulons verfolgt. Darüber hinaus planen wir, das Labor zu einem Referenzlabor für 'Proteomics pathogener Gram-positiver Bakterien' auszubauen, um neue Erkenntnisse über die Mechanismen der Pathogenität zu erlangen. Für die im Antrag aufgeührten Projekte ist die Beschaffung eines MALDI-TOF-MS oder Q-Q-TOF-MS unabdingbare Voraussetzung zur schnellen Identifizierung der Proteine.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen