Funktionelle Analyse und gerichtete Manipulation von dynamischen Chromatin-Mechanismen an rRNA Genen in Säugerzellen (A35*)

• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 213249687

Unterschiedliche Zelltypen exprimieren bemerkenswert unterschiedliche Mengen an ribosomaler RNA und besitzen folglich sehr unterschiedliche zelluläre Protein-Translationsraten. Trotzdem ist es weitgehend unbekannt, welche Chromatin-Mechanismen die Aktivitäten der rRNA Gene regulieren. Basierend auf abgewandelten CRISPR Ansätzen haben wir kürzlich eine Methode entwickelt, Chromatin an rRNA Genen in vitro und in vivo zu manipulieren. Nun werden wir diese Strategien nutzen, um die Bedeutung einer Reihe von Chromatin Bestandteilen (UBF, PARP, FACT) und Mechanismen (DNA Methylierung, Nucleosom Platzierung, nicht kodierende RNAs, lokale Stoffwechselsignale) zu manipulieren und zu untersuchen, welche davon rRNAs, Protein-Translationsraten und Stammzellverhalten regulieren.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1064: Chromatindynamik
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Stefan Stricker