Strukturelle Grundlagen der Protonendynamik in Viroporinen durch Multiskalenmodellierung und -simulation (C07*)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung seit 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 221545957

In diesem Projekt werden rechnergestützte Methoden entwickelt und angewendet, mit denen die Kopplung zwischen langsamen Konformationsänderungen und Protonierungsdynamik in Proteinen untersucht werden können. Durch die Kombination von statistischer Mechanik, maschinellem Lernen und Moleküldynamik-Simulationen werden wir grobkörnige und multiskalige Modelle der globalen Strukturänderungen und deren Kopplung mit (De-)Protonierungsereignissen in Phytochromen untersuchen. Außerdem werden wir die strukturelle Basis der Protonenleitung in den neuen viralen Protonenkanälen (Viroporine) erforschen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1078: Proteinfunktion durch Protonierungsdynamik
• Antragstellende Institution: Freie Universität Berlin
• Teilprojektleiterin: Professorin Cecilia Clementi, Ph.D.