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SPP 2330: Neue Konzepte der Virus-Wirt Interaktion in Prokaryoten – von Einzelzellen zu mikrobiellen Gemeinschaften
Fachliche Zuordnung
Medizin
Biologie
Chemie
Informatik, System- und Elektrotechnik
Wärmetechnik/Verfahrenstechnik
Biologie
Chemie
Informatik, System- und Elektrotechnik
Wärmetechnik/Verfahrenstechnik
Förderung
Förderung seit 2021
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 441953848
Im Rahmen dieses Schwerpunktprogramms (SPP 2330) wird sich ein Konsortium aus ca. 25 Gruppen zusammenschließen, um sich auf aktuelle Themenfelder im Bereich der Virus-Wirt-Interaktion in Prokaryoten zu fokussieren. In den letzten Jahren wurden hier revolutionäre Entdeckungen bezüglich der Biologie prokaryotischer Viren gemacht. Dazu gehörte u.a. die Erkenntnis, dass Viren kleine Moleküle nutzen können, um Entscheidungen auf Gruppenebene zu treffen, die Entdeckung komplexer intrazellulärer Strukturen, die von Viren gebildet werden sowie eine Vielzahl neuartiger antiviraler Immunsysteme, die auf Einzelzell- und multizellulärer Ebene wirken. Diese bahnbrechenden neuen Entdeckungen haben ein enormes Forschungsinteresse an der Phagenbiologie geweckt. Das interdisziplinäre Konsortium dieses SPPs integriert Expertisen aus den Bereichen der molekularen Mikrobiologie, Bioinformatik, mathematischen Modellierung, bildgebenden Verfahren, Strukturbiologie und Biochemie und wird auf diese Weise einen wichtigen und international sichtbaren Beitrag zu diesem Forschungsfeld leisten. Der neu eingerichtete SPP konzentriert sich auf drei Komplexitätsskalen der viralen Organisation, welche die (i) virale Zellbiologie, (ii) neue ein- und mehrzellige antivirale Abwehrmechanismen und (iii) die Auswirkungen des Virus auf komplexe, mikrobielle Gemeinschaften umfassen. Die grundlegenden Ziele dieses Konsortiums sind das Verständnis neuer Mechanismen der Virus-Wirt-Interaktionen in Prokaryoten auf molekularer Ebene sowie im Kontext von mikrobiellen Gemeinschaften. Dies wird es uns ermöglichen, den Einfluss unterschiedlicher viraler Lebensstile auf die Entwicklung antiviraler Strategien zu untersuchen und letztlich Licht in das evolutionäre Wettrüsten auf der Ebene mikrobieller Gemeinschaften zu bringen. Es ist das Ziel dieses SPPs gemeinsam neue Konzepte und Mechanismen im Bereich der Virus-Wirt Interaktion in Prokaryoten zu entschlüsseln. Diese haben unter Umständen ein hohes Anwendungspotential für wie Entwicklung molekularbiologischer Werkzeuge, in der Phagentherapie, der Lebensmittelindustrie oder Landwirtschaft.Der Erfolg eines Schwerpunktprogramms hängt im Wesentlichen von der Schaffung der richtigen Rahmenbedingungen ab. Deshalb beantragen wir Mittel für die Organisation von Jahrestagungen sowie einer internationalen Konferenz (im 3. Jahr), für die Organisation von Workshops, Studentenaustausche, eine Anschubfinanzierung von Postdocs, Gleichstellungsmaßnahmen und ein Modul zur Öffentlichkeitsarbeit. Die Koordinationsmittel werden von der Koordinatorin, dem Koordinationsausschuss und einem Gleichstellungsausschuss verwaltet, die alle von der Koordinationsassistentin des SPP unterstützt werden.
DFG-Verfahren
Schwerpunktprogramme
Internationaler Bezug
Belgien, Israel, Niederlande, Portugal, Schweiz
Projekte
- Charakterisierung des bakteriellen Epitranskriptoms auf der Grundlage von Escherichia coli und T4 Phagen Interaktionen (Antragstellerin Höfer, Katharina )
- Charakterisierung von Anti-Phagen-Verteidigungsinseln in Prokaryoten (Antragsteller Sorek, Ph.D., Rotem )
- Der Einfluss von Viren auf marine heterotrophe Bakterien - von einzelnen Zellen bis hin zu einzelnen Metaboliten – eine Einzelzellen-Perspektive (Antragstellerinnen / Antragsteller Moraru, Ph.D., Cristina ; Stryhanyuk, Ph.D., Hryhoriy )
- Die Rolle der m6A-RNA-Modifikation zur Kontrolle der Phagenreplikation (Antragstellerinnen Brameyer, Sophie ; Jung, Kirsten )
- Die Rolle kleiner offener Leserahmen des Shewanella oneidensis-Phagen LambdaSo bei der Übernahme des Wirtes und der Phagenvermehrung (Antragsteller Thormann, Kai )
- Die Rolle von Membranvesikeln für Virus-Wirts Interaktionen in Archaeen (Antragstellerin Erdmann, Susanne )
- "Dynamik und Mechanismen der frühen Wechselwirkungen zwischen Bakteriophagen und seinem Bakterienwirt in der Haut" (Antragstellerin Gomez de Agüero, Mercedes )
- Glcocode-vermittelte Bakteriophagen-Wirtinteraktion in der Evolution des Genus Staphylococcus (Antragsteller Peschel, Andreas )
- Identifizierung von molekularen Faktoren des ΦKZ Phagen zur Modulation der Wirtsproteinsynthese. (Antragsteller Vogel, Jörg )
- Identität, Infektionsstrategie und biogeochemische Relevanz von Umweltviren die nitrifizierende Mikroorganismen infizieren (Antragsteller Pester, Michael )
- Inhibierung der Phageninfektion durch aktinobakterielle Sekundärmetabolite (Antragstellerin Frunzke, Julia )
- Koordinationsfonds (Antragstellerin Frunzke, Julia )
- Molekulare Interaktion zwischen Sa3int Phagen und dem Wirtsbakterium Staphylococcus aureus (Antragstellerin Wolz, Christiane )
- Molekulare Mechanismen des Virusaustritts in Haloarchaea (Antragstellerin Quax, Tessa )
- Molekulare Prinzipien der Quorum-Sensing-vermittelten Phagenabwehr bei Vibrio cholerae (Antragsteller Papenfort, Kai )
- Molekularer Einblick in die Virusinfektion von Methanoarchaeen und ihre jeweiligen Viren (Antragstellerin Schmitz-Streit, Ruth Anne )
- Systematische Identifizierung der Phagen-Wirt-Interaktionen im menschlichen Darm (Antragstellerinnen / Antragsteller Deng, Li ; Müller, Christian L. ; Söding, Johannes )
- Untersuchung neuartiger Immunsysteme zur Abwehr von Phagen in nativen bakteriellen Wirten (Antragsteller Beisel, Chase )
- Untersuchungen von neuartigen, transkriptionell vermittelten Anti-Phagen-Resistenz-Mechanismen (Antragstellerinnen Lindell, Ph.D., Debbie ; Steglich, Claudia )
- Wechselwirkungen von Bakteriophagen mit Glykan-basierten Biofilmen und Kontrolle durch Depolymerase-Enzyme (Antragstellerin Barbirz, Stefanie )
- Welche Rolle spielen Cyanophagen-kodierte metabolische Hilfsgene in der Virozelle? (Antragstellerin Frankenberg-Dinkel, Nicole )
- Z-Projekt - Bacteriophagen Repositorium, Services und Databank-Aufbau (Antragsteller Overmann, Jörg ; Wittmann, Johannes )
- Zusammenspiel der Phagen phi29 und SPP1 mit der (p)ppGpp-Antwort von B. subtilis (Antragsteller Bange, Gert )
Sprecherin
Professorin Dr. Julia Frunzke