Die Rolle der arcRNAs bei der Spleißreaktion auf Hypoxie (A03)

• Fachliche Zuordnung: Zellbiologie ; Biochemie ; Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung seit 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 403584255

Architektonische RNAs (arcRNAs) bilden das Gerüst für nukleäre Kondensate, welche durch ihr dynamisches Auftreten und die reversible Sequestrierung spezifischer RNA-bindender Proteine eine globale Reprogrammierung der Genexpression als Reaktion auf spezifische Stressfaktoren, wie Hypoxie, ermöglichen. Durch die Kombination von Zellbiologie, Biochemie, bioinformatischen Analysen und multimodaler Datenintegration wollen wir die Funktionen von semi-extrahierbaren Intron-Retentions-Transkripten – einer neuen Art von arcRNAs – entschlüsseln, die Rolle der Kondensat-Dynamik während der Hypoxie-Anpassung verfolgen und die physiologische Bedeutung von arcRNAs bei der alternativen Spleiß-Reaktion unter Hypoxie untersuchen.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 267: Nichtkodierende RNA im kardiovaskulären System
• Antragstellende Institution: Technische Universität München (TUM)
• Teilprojektleiterinnen: Professorin Michaela Müller-McNicoll; Dr. Katharina Zarnack, seit 7/2023