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Höchstdurchsatz Short Read DNA-Sequenziergerät
Fachliche Zuordnung
Grundlagen der Biologie und Medizin
Förderung
Förderung in 2019
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 424726534
Das DRESDEN-concept Genome Center der TU Dresden ist eine zentrale Einheit zur Durchführung von Experimenten auf Basis der Hochdurchsatz-Sequenzierung (NGS) welche von den wissenschaftlichen Gruppen am Campus umfassend genutzt wird. Um die von den Gruppen und am Genome Center geplanten Entwicklungen und Projekte schnell voranzutreiben, ist eine deutliche Erhöhung der lokalen Sequenzierkapazität erforderlich. Zusätzlich soll das Gerät umfassend für unsere Arbeit als DFG NGS Kompetenzzentrum genutzt werden. Dies umfasst auch eigene Entwicklungen wie Algorithmen für hochwertige Genomassemblierung oder Methoden für die effiziente multidimensionale Einzelzellanalyse. Durch die Verstärkung der Sequenzierkapazität sollen in Zukunft auch durchsatzintensivere Anwendungen wie genomweite Bisulfit-Sequenzierung, HiC-Sequencing, die Nutzung von linked Read Sequencing und große Einzelzellstudien in Dresden möglich sein. Dafür ist ein hinsichtlich Durchsatz extrem skalierbares System erforderlich, welches die qualitativ hochwertige und zugleich kosteneffiziente Analyse von mittleren bis großen Studien ermöglicht.
DFG-Verfahren
Forschungsgroßgeräte
Großgeräte
Höchstdurchsatz Short Read DNA-Sequenziergerät
Gerätegruppe
3150 DNA-Sequenzer
Antragstellende Institution
Technische Universität Dresden
Leiter
Dr. Andreas Dahl