Protein-PNA Konjugate als konditionelle BRET Plattform für Lebendzell mRNA Imaging und Quantifizierung

• Antragsteller: Dr. Frank Abendroth
• Fachliche Zuordnung: Biologische und Biomimetische Chemie
• Förderung: Förderung von 2019 bis 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 423428279

Im Rahmen des hier vorgeschlagenen Projektes soll ein neues hochsensitives Verfahren entwickelt werden, das es erlaubt multiple und in geringer Zahl vorliegende mRNA-Isoformen in Zellen in Echtzeit zu visualisieren und räumlich zu quantifizieren.Trotz vielfältiger RNA-bildgebender Verfahren ist es aufgrund der mangelnden Sensitivität der vorhandenen Methoden bisher nicht möglich gewesen mRNA-Isoformen, die sehr oft in geringer Kopienzahl vorliegen, in Echtzeit an lebenden Zellen zu studieren. Diese durch alternatives Spleißen gebildeten Transkripte tragen deutlich zur Proteinvielfalt bei und spielen insbesondere bei der Entwicklung der neuronalen Plastizität sowie bei Erkrankungen des Nervensystems (Alzheimer, spinale Muskelatrophie) eine zentrale Rolle. Ziel dieses Projektes ist es eine neue Methode zu entwickeln, die es erlaubt die Genexpression von Transkripten in Echtzeit zu verfolgen. Am Beispiel von zwei gut charakterisierten mRNA-Isoformen mit Bezug zur spinalen Muskelatrophie dieses neue Verfahren letztendlich in genetisch modifizierten Zellen und Patienten-Fibroblasten getestet werden.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen