Untersuchung von Protein-Nukleotid-Interaktionen mittels Molekulardynamiksimulationen (A16*)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung von 2018 bis 2022
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 105286809

Mittels Molekulardynamiksimulationen (MD) untersuchen wir Konformationsübergänge der RNA-Polymerase II (Pol II) sowie mehrerer Mitglieder der Familie der RNA-Helikasen. Insbesondere planen wir, energetisch und sterisch mögliche Pfade für das Öffnen des DNA-Strangs in Pol II zu ermitteln. Zudem verwenden wir SAXS-getriebene MD-Simulationen und Freie-Energie-Rechnungen, um die Mechanismen des Laden und Gleiten von RNA durch RNA-Helikasen zu untersuchen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 860: Integrative Strukturbiologie dynamischer makromolekularer Komplexe
• Antragstellende Institution: Georg-August-Universität Göttingen
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Jochen Hub