GSC 220:  Heidelberger Graduiertenschule der mathematischen und computergestützten Methoden für die Wissenschaften

• Fachliche Zuordnung: Mathematik ; Grundlagen der Biologie und Medizin ; Informatik ; Medizin ; Physikalische Chemie ; Wasserforschung
• Förderung: Förderung von 2007 bis 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 39072701

• Erstellungsjahr: 2019

Zusammenfassung der Projektergebnisse

Wissenschaftliches Rechnen – die Wissenschaft von der Entwicklung mathematischer und rechnergestützter Methoden zur Lösung von Anwendungsproblemen – wird als eine Schlüsseltechnologie des 21. Jahrhunderts angesehen. Hohe Erwartungen an Modellierung, Simulation und Optimierung, die Datenflut durch hochauflösende Bildgebung und Hochdurchsatz-Experimente, die Kombination von daten- und prozessorientierter Modellierung sowie die entstehende Nachfrage aus Forschungsfeldern jenseits der Naturwissenschaften stellen dabei Herausforderungen dar, die nur durch entsprechende methodische Fortschritte bewältigt werden können. Das Interdisziplinäre Zentrum für Wissenschaftliches Rechnen (IWR) bearbeitet diese Forschungsfragen seit Jahren erfolgreich als zentrale Forschungseinrichtung der Universität Heidelberg. Die Graduiertenschule HGS MathComp ist nun eine unabhängige Forschungseinrichtung der Universität Heidelberg mit der Bestimmung als zentrale interdisziplinäre Ausbildungsstätte für Doktoranden. 50 Arbeitsgruppen mit 25 Jahren Erfahrung in der strukturierten Doktorandenausbildung bildeten die wesentliche Grundlage für eine erfolgreiche erste und zweite Förderperiode. Es gibt in Wissenschaft und Industrie eine anhaltend hohe Nachfrage nach jungen Wissenschaftlern mit einer sehr guten Ausbildung in den Methoden des wissenschaftlichen Rechnens und deren Anwendung. Die HGS MathComp deckt diesen Bedarf mit einer strukturierten Doktorandenausbildung, die in ein interdisziplinäres Forschungsumfeld eingebettet ist, welches die Entwicklung von neuen und leistungsfähigen Methoden fördert. Das wissenschaftliche Kursprogramm wird durch Schlüsselkompetenzkurse ergänzt, welche Fähigkeiten vermitteln, die von zukünftigen führenden Wissenschaftlern erwartet werden. Vorträge auf internationalen Tagungen und Forschungsaufenthalte im Ausland dienen der frühen Integration in die wissenschaftliche Gemeinschaft. Ergänzt wird dies durch internationale Gastwissenschaftler und ein Gastdoktoranden-Programm, welches in einem Netzwerk von Partnerinstitutionen eingebettet ist. Ausgehend von mehr als 250 erfolgreichen Promotionen und derzeit etwa 100 hervorragenden Doktoranden wird die Graduiertenschule nun eine permanente, unabhängige Einrichtung werden, welche ihre Angebote, gemeinsam mit den Partnerinstitutionen und der Graduiertenakademie, weiterführt und weiterentwickelt. Ermutigt durch die bereits erzielten Erfolge in beiden Förderperioden wird sich die Schule weiterhin darauf konzentrieren, Möglichkeiten für universitätsweite, interdisziplinäre Kooperationen zu erschließen und somit ihrem Auftrag als brückenbildende Institution gerecht zu werden. Eine integrierte, forschungsorientierte Master-Phase trägt zur forschungsbasierten Lehre der Gesamtuniversität bei und der internationale Master-Studiengang ‘Scientific Computing’, welcher an der Fakultät für Mathematik und Informatik etabliert wurde, erlaubt eine maßgeschneidertensaustausch zwischen Industrie und Hochschule ist durch die etablierten Modellierungstage und das sehr erfolgreich Heidelberg Collaboratory for Image Processing sichergestellt. Der ausgereifte Nachhaltigkeitsplan stellt die langfristige Perspektive der HGS MathComp als eine herausragende interdisziplinäre Einrichtung sicher, die fest in der Universität und der internationalen Forschungsgemeinschaft verankert ist.

Link zum Abschlussbericht

https://doi.org/10.2314/KXP:1698966601

Projektbezogene Publikationen (Auswahl)

• Integrating genomic and transcriptomic data into graph based approaches for defining essential reactions in the metabolic network of escherichia coli. In A. Hinneburg, editor, LWA 2007, pages 55–60. 2007
  K. Plaimas, M. Oswald, R. Eils, and R. König
  
• Random loop model for long polymers. Physical Review E, 76(5, 1), Nov 2007
  M. Bohn, D. W. Heermann, and R. van Driel
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1103/PhysRevE.76.051805)
• Average crossing number of gaussian and equilateral chains with and without excluded volume. The European Physical Journal, 62(2):209–214, 2008
  P. M. Diesinger and D. W. Heermann
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1140/epjb/e2008-00145-6)
• Inverse problem of lindenmayer systems on branching structures. In Modeling, simulation and optimization of complex processes, pages 163–185. 2008
  S. Chuai-Aree, W. Jäger, and H. G. Bock
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/978-3-540-79409-7_11)
• Goal-oriented error control of the iterative solution of finite element equations. Journal of Numerical Mathematics, 17:143–172, 07 2009
  D. Meidner, R. Rannacher, and J. Vihharev
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1515/JNUM.2009.009)
• Modeling of Asymmetric Cell Division in Hematopoietic Stem Cells-Regulation of Self-Renewal Is Essential for Efficient Repopulation. Stem Cells And Development, 18(3):377–385, Apr 2009
  A. Marciniak-Czochra, T. Stiehl, A. D. Ho, W. Jaeger, and W. Wagner
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1089/scd.2008.0143)
• Reconstructing nonlinear dynamic models of gene regulation using stochastic sampling. BMC Bioinformatics, 10, Dec 28 2009
  J. Mazur, D. Ritter, G. Reinelt, and L. Kaderali
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1186/1471-2105-10-448)
• When less can yield more - Computational preprocessing of MS/MS spectra for peptide identification. Proteomics, 9(21):4978–4984, Nov 2009
  B. Y. Renard, M. Kirchner, F. Monigatti, A. R. Ivanov, J. Rappsilber, D. Winter, J. A. J. Steen, F. A. Hamprecht, and H. Steen
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1002/pmic.200900326)
• A multiscale model for red blood cell mechanics. Biomechanics and Modeling In Mechanobiology, 9(1):1–17, Feb 2010
  D. Hartmann
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/s10237-009-0154-5)
• Adaptive finite element solution of eigenvalue problems. Journal of Numerical Mathematics, 18(4):303–327, 2010
  R. Rannacher, A. Westenberger, and W. Wollner
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1515/jnum.2010.015)
• Electron-Transfer Properties of an Efficient Nonheme Iron Oxidation Catalyst with a Tetradentate Bispidine Ligand. Angewandte Chemie - International Edition, 49(14):2622–2625, 2010
  P. Comba, S. Fukuzumi, H. Kotani, and S. Wunderlich
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.200904427)
• Magnesium-Dependent Active-Site Conformational Selection in the Diels-Alderase Ribozyme. Journal of the American Chemical Society, 132(36):12587–12596, Sep 15 2010
  T. Berezniak, M. Zahran, P. Imhof, A. Jaeschke, and J. C. Smith
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1021/ja101370e)
• Minimal curvature trajectories: Riemannian geometry concepts for slow manifold computation in chemical kinetics. Journal of Computational Physics, 229(18):6512–6533, Sep 1 2010
  D. Lebiedz, V. Reinhardt, and J. Siehr
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jcp.2010.05.008)
• PathWave: discovering patterns of differentially regulated enzymes in metabolic pathways. Bioinformatics, 26(9):1225–1231, May 1 2010
  G. Schramm, S. Wiesberg, N. Diessl, A.-L. Kranz, V. Sagulenko, M. Oswald, G. Reinelt, F. Westermann, R. Eils, and R. Koenig
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq113)
• Automated Detection and Segmentation of Synaptic Contacts in Nearly Isotropic Serial Electron Microscopy Images. PLoS One, 6(10), Oct 21 2011
  A. Kreshuk, C. N. Straehle, C. Sommer, U. Koethe, M. Cantoni, G. Knott, and F. A. Hamprecht
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pone.0024899)
• Large eddy simulation of the unsteady flow-field in an idealized human mouth-throat configuration. Journal of Biomechanics, 44(16):2768–2774, 2011
  X. Cui and E. Gutheil
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jbiomech.2011.08.019)
• Measuring oxygen reduction/evolution reactions on the nanoscale. Nature Chemistry, 3(9):707–713, Sep 2011
  A. Kumar, F. Ciucci, A. N. Morozovska, S. V. Kalinin, and S. Jesse
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nchem.1112)
• Modeling of auto-catalytic halogen release and ozone depletion in polar regions. Journal of Physics, 318 (6 S.), 2011
  L. Cao and E. Gutheil
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1088/1742-6596/318/7/072006)
• Optimization as an analysis tool for human complex problem solving. SIAM Journal on Optimization, 21(3):936–959, 2011
  S. Sager, C. M. Barth, H. Diedam, M. Engelhart, and J. Funke
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1137/11082018X)
• Bichromatic particle streak velocimetry bPSV. Experiments In Fluids, 53(5):1405–1420, Nov 2012
  B. Voss, J. Stapf, A. Berthe, and C. S. Garbe
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/s00348-012-1355-8)
• Efficient direct multiple shooting for nonlinear model predictive control on long horizons. Journal of Process Control, 22(3):540–550, 2012
  C. Kirches, L. Wirsching, H. G. Bock, and J. P. Schlöder
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jprocont.2012.01.008)
• Estimating parameters in optimal control problems. SIAM Journal on Scientific Computing, 34(3):A1707–A1728, 2012
  K. Hatz, J. P. Schloeder, and H. G. Bock
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1137/110823390)
• Expression-dependent folding of interphase chromatin. PLoS One, 7(2012), 2012
  H. Jerabek and D. W. Heermann
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pone.0037525)
• On the development and generalizations of Cahn- Hilliard equations within a thermodynamic framework. Zeitschrift für Angewandte Mathematik und Physik, 63(1):145–169, Feb 2012
  M. Heida, J. Malek, and K. R. Rajagopal
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/s00033-011-0139-y)
• One Plus One Makes Three (for Social Networks). PLoS One, 7(4), Apr 6 2012
  E.-A. Horvat, M. Hanselmann, F. A. Hamprecht, and K. A. Zweig
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pone.0034740)
• Rif2 Promotes a Telomere Fold-Back Structure through Rpd3L Recruitment in Budding Yeast. PLoS Genetics, 8(9), Sep 2012
  H. Poschke, M. Dees, M. Chang, S. Amberkar, L. Kaderali, R. Rothstein, and B. Luke
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002960)
• Similarity analysis of cell movements in video microscopy. IEEE Symposium on Biological Data Visualization 2012, Biovis 2012 - Proceedings, Pages 69–76, 2012
  J. Fangerau, B. Höckendorf, J. Wittbrodt, and H. Leitte
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1109/BioVis.2012.6378595)
• Unwrapping of Nucleosomal DNA Ends: A Multiscale Molecular Dynamics Study. Biophysical Journal, 102(4):849–858, Feb 22 2012
  K. Voltz, J. Trylska, N. Calimet, J. C. Smith, and J. Langowski
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.bpj.2011.11.4028)
• A systems medicine research approach for studying alcohol addiction. Addiction biology, 18(6):883–896, 2013
  R. Spanagel, G. Koehr, F. Matthäus, H. R. Noori, and W. H. Sommer
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1111/adb.12109)
• Adaptive finite element analysis of nonlinear problems. Journal of numerical mathematics, 21(1):23–62, 2013
  R. Rannacher and J. Vihharev
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1515/jnum-2013-0002)
• Chromosome segregation by the Escherichia coli Min system. Molecular Systems Biology, 9, Sep 2013
  B. Di Ventura, B. Knecht, H. Andreas, W. J. Godinez, M. Fritsche, K. Rohr, W. Nickel, D. W. Heermann, and V. Sourjik
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/msb.2013.44)
• COAL: a generic modelling and prototyping framework for convex optimization problems of variational image analysis. Optimization Methods & Software, 28(5):1081–1094, Oct 1 2013
  D. Breitenreicher, J. Lellmann, and C. Schnoerr
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1080/10556788.2012.672571)
• Computational and experimental analysis identified 6-diazo-5-oxonorleucine as a potential agent for treating infection by Plasmodium falciparum. Infection Genetics and Evolution, 20:389–395, Dec 2013
  K. Plaimas, Y. Wang, S. O. Rotimi, G. Olasehinde, S. Fatumo, M. Lanzer, E. Adebiyi, and R. Koenig
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.meegid.2013.09.019)
• Eulerian techniques for fluid-structure interactions. In A. Abdulle, S. Deparis, D. Kreßner, F. Nobile, and M. Picasso, editors, Numerical Mathematics and Advanced Applications - ENUMATH 2013, pages 745–754. 2015
  S. Frei, T. Richter, and T. Wick
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/978-3-319-10705-9_74)
• Identifying a parameterisation of the soil water retention curve from on-ground gpr measurements. Hydrology and Earth System Sciences Discussions, 17(2):611–618, 2013
  A. Dagenbach, J. S. Buchner, P. Klenk, and K. Roth
  (Siehe online unter https://doi.org/10.5194/hess-17-611-2013)
• Integer programming models for the target visitation problem. In Proceedings of the 16th International Multiconference Information Society - IS 2013, Pages 569–572, 2013
  A. Hildenbrandt, G. Reinelt, and O. Heismann
  
• Optimality Bounds for a Variational Relaxation of the Image Partitioning Problem. Journal of Mathematical Imaging and Vision, 47(3, Si):239–257, Nov 2013
  J. Lellmann, F. Lenzen, and C. Schnoerr
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/s10851-012-0390-7)
• Organism-adapted specificity of the allosteric regulation of pyruvate kinase in lactic acid bacteria. PLoS ONE, 9, 2013
  N. V. Veith, A. Feldman-Salit, U. Kummer, and R. C. Wade
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003159)
• Replication vesicles are load- and choke-points in the hepatitis c virus lifecycle. PLoS Pathogens, 9, 2013
  M. Binder, N. Sulaimanov, S. M. Lenz, J. P. Schlöder, R. Bartenschlager, V. Lohmann, and L. Kaderali
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1003561)
• Uncertainty Quantification in Complex Simulation Models Using Ensemble Copula Coupling. Statistical Science, 28(4, Si):616–640, Nov 2013
  R. Schefzik, T. L. Thorarinsdottir, and T. Gneiting. Uncertainty Quantification in Complex Simulation Models Using Ensemble Copula Coupling.
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1214/13-STS443)
• A Case Study on a Quality Assurance Process for a Scientific Framework. Computing in Science & Engineering, 16(3):58–66, May-Jun 2014
  H. Remmel, B. Paech, C. Engwer, and P. Bastian
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1109/MCSE.2014.57)
• Depletion of the chromatin looping proteins ctcf and cohesin causes chromatin compaction. PLoS Computational Biology, 10(2014), 2014
  M. Tark-Dame, H. Jerabek, and D. W. Heermann
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1004716)
• Detection of amines with extended distyrylbenzenes by strip assays. The Journal of Organic Chemistry, 79(14):6634–6645, 2014
  J. Kumpf, J. Freudenberg, K. M. Fletcher, A. Dreuw, and U. H. F. Bunz
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1021/jo501129d)
• How chromatin looping and nuclear envelope attachment affect genome organization in eukaryotic cell nuclei. International Review of Cell and Molecular Biology, 307:351–381, 2014
  H. Jerabek and D. W. Heermann
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/b978-0-12-800046-5.00010-2)
• Modeling and simulation of tropospheric ozone depletion in the polar spring. In Fundamental issues and perspectives in fluid mechanics, industrial and environmental applications of fluid mechanics, issues and perspectives in automotive flows, gas-solid flows. American Society of Mechanical Engineers, 2014
  L. Cao and E. Gutheil
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1115/FEDSM2014-22045)
• Modeling and simulation of water and pvp/water evaporating spray flows using the direct quadrature method of moments. Atomization and Sprays, 24(5):403–429, 2014
  S. R. Gopireddy, R. M. Humza, and E. Gutheil
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1615/AtomizSpr.2014008479)
• Spike patterns in a reaction-diffusion ODE model with turing instability. Mathematical Methods in the Applied Sciences, 37(9):1377–1391, 2014
  S. Härting and A. Marciniak-Czochra
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1002/mma.2899)
• The affinely invariant distance correlation. Bernoulli, 20(4):2305–2330, Nov 2014
  J. Dueck, D. Edelmann, T. Gneiting, and D. Richards
  (Siehe online unter https://doi.org/10.3150/13-BEJ558)
• A new model for the aerobic metabolism of yeast allows the detailed analysis of the metabolic regulation during glucose pulse. Biophysical Chemistry, 206:40–57, 2015
  D. Kesten Weth, U. Kummer, S. Sahle, and K. Hübner
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.bpc.2015.06.010)
• Adapting algebraic diagrammatic construction schemes for the polarization propagator to problems with multi-reference electronic ground states exploiting the spin-flip ansatz. Journal of Chemical Physics, 143(12), Sep 28 2015
  D. Lefrancois, M. Wormit, and A. Dreuw
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1063/1.4931653)
• An Active-Set Quadratic Programming Method Based On Sequential Hot-Starts. SIAM Journal on Optimization, 25(2):967–994, 2015
  T. Johnson, C. Kirches, and A. Wächter
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1137/130940384)
• Application of reactive transport modeling to growth and transport of microorganisms in the capillary fringe. Vadose Zone Journal, 14(5):1–17, 2015
  P. Hron, P. Bastian, and O. Ippisch
  (Siehe online unter https://doi.org/10.2136/vzj2014.07.0092)
• Crucial HSP70 co-chaperone complex unlocks metazoan protein disaggregation. Nature, 524(7564):247+, Aug 13 2015
  N. B. Nillegoda, J. Kirstein, A. Szlachcic, M. Berynskyy, A. Stank, F. Stengel, K. Arnsburg, X. Gao, A. Scior, R. Aebersold, D. L. Guilbride, R. C. Wade, R. I. Morimoto, M. P. Mayer, and B. Bukau
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nature14884)
• A weakly penalized discontinuous galerkin method for radiation in dense, scattering media. Computational methods in applied mathematics, 16(4):563–577, 2016
  G. Kanschat and J. P. Lucero Lorca
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1515/cmam-2016-0023)
• Advances in Quantum Mechanochemistry: Electronic Structure Methods and Force Analysis. Chemical Reviews, 116(22):14137–14180, Nov 23 2016
  T. Stauch and A. Dreuw
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.6b00458)
• Asymmetric mono- and dinuclear Ga-III and Zn-II complexes as models for purple acid phosphatases. Journal of Inorganic Biochemistry, 162:343–355, Sep 2016
  S. Bosch, P. Comba, L. R. Gahan, and G. Schenk
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2015.12.028)
• Cooperative data fusion of transmission and surface scan for improving limited-angle computed tomography reconstruction. NDT & E International, 83:24–31, Oct 2016
  Y. Liu, A. Beyer, P. Schuetz, J. Hofmann, A. Flisch, and U. Sennhauser
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.ndteint.2016.05.003)
• Knots “Choke Off” Polymers upon Stretching. Angewandte Chemie - International Edition, 55(2):811–814, Jan 11 2016
  T. Stauch and A. Dreuw
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.201508706)
• Mass concentration in a nonlocal model of clonal selection. Journal of Mathematical Biology, 73(4):1001–1033, 2016
  J.-E. Busse, P. Gwiazda, and A. Marciniak-Czochra
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/s00285-016-0979-3)
• Mathematical modeling and simulation of the evolution of plaques in blood vessels. Journal of Mathematical Biology, 72(4, Si):973–996, Mar 2016
  Y. Yang, W. Jaeger, M. Neuss-Radu, and T. Richter
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/s00285-015-0934-8)
• The deal.ii library, version 8.3. Archive of numerical software, 4(100):1–11, 2016
  W. Bangerth, G. Kanschat, and M. Maier
  (Siehe online unter https://doi.org/10.11588/ans.2016.100.23122)
• The Radical Anion and Dianion of Tetraazapentacene. Angewandte Chemie - International Edition, 55(35):10498–10501, Aug 22 2016
  L. Ji, M. Haehnel, I. Krummenacher, P. Biegger, F. L. Geyer, O. Tverskoy, M. Schaffroth, J. Han, A. Dreuw, T. B. Marder, and U. H. F. Bunz
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1002/anie.201603177)
• An objective comparison of cell-tracking algorithms. Nature Methods, 14(12):1141+, Dec 2017
  V. Ulman, M. Maska, K. E. G. Magnusson, O. Ronneberger, C. Haubold, N. Harder, P. Matula, P. Matula, D. Svoboda, M. Radojevic, I. Smal, K. Rohr, J. Jalden, H. M. Blau, O. Dzyubachyk, B. Lelieveldt, P. Xiao, Y. Li, S.-Y. Cho, A. C. Dufour, J.-C. Olivo-Marin, C. C. Reyes-Aldasoro, J. A. Solis-Lemus, R. Bensch, T. Brox, J. Stegmaier, R. Mikut, S. Wolf, F. A. Hamprecht, T. Esteves, P. Quelhas, O. Demirel, L. Malmstrom, F. Jug, P. Tomancak, E. Meijering, A. Munoz-Barrutia, M. Kozubek, and C. Ortiz-de Solorzano
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.4473)
• Distance correlation coefficients for Lancaster distributions. Journal of Multivariate Analysis, 154:19–39, Feb 2017
  J. Dueck, D. Edelmann, and D. Richards
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.jmva.2016.10.012)
• Dopelib: differential equations and optimization environment. Archive of Numerical Software, 5(2):1–14, 2017
  C. Goll, T. Wick, and W. Wollner
  (Siehe online unter https://doi.org/10.11588/ans.2017.2.11815)
• High performance computing for cognitionguided cardiac surgery. In H. G. Bock, H. X. Phu, R. Rannacher, and J. P. Schlöder, editors, Modeling, Simulation and Optimization of Complex Processes HPSC 2015, pages 205–221. 2017
  N. Schoch, R. De Simone, and V. Heuveline
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1007/978-3-319-67168-0_17)
• Multicut brings automated neurite segmentation closer to human performance. Nature Methods, 14(2):101–102, Feb 2017
  T. Beier, C. Pape, N. Rahaman, L. Prange, S. Berg, D. D. Bock, A. Cardona, G. W. Knott, S. M. Plaza, L. K. Scheffer, U. Koethe, A. Kreshuk, and F. A. Hamprecht
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1038/nmeth.4151)
• Numerical modeling of heat exchange and unsaturatedsaturated flow in porous media. Computers & Mathematics With Applications, 77(6):1668–1680, Mar 15 2019. 7th International Conference on Advanced Computational Methods in Engineering (ACUMEN), Ghent Univ., Ghent, Belgium, Sep 18-22, 2017
  J. Kacur, P. Mihala, and M. Toth
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.camwa.2018.06.009)
• Optimal control based stiffness identification of an ankle-foot orthosis using a predictive walking model. Frontiers in computational neuroscience, 11, 2017
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