Maschinelles Lernen von grobskaliger Molekulardynamik von Molekülkomplexen (A12)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung seit 2016
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 278001972

Project A12 zielt auf die quantitative Modellierung von Proteinkomplexen und Multimeren für drei verschiedene molekulare Prozesse ab: (i) Die Dynamik und Interaktionen des Komplexin Proteins als Teil des synaptischen Exozytosemechanismus; (ii) den katalysierte Peptidaustausch und die Bindungsspezifität von Proteinen des Major Histocompatibility Complex und (iii) die Bindung von Substratproteinen an Palmitoyltransferasen der DHHC Familie. Um biologisch relevante Zeit- und Längenskalen zu erreichen, verwenden wir eine Verbindung von atomistischen und maschinell gelernten grobskaligen Modellen in Zusammenarbeit mit unseren experimentellen Kooperationspartnern.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 186: Molekulare Schalter zur räumlichen und kinetischen Regulation der zellulären Signaltransmission
• Antragstellende Institution: Freie Universität Berlin
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professorin Cecilia Clementi, Ph.D.; Professor Dr. Frank Noé, bis 9/2022; Dr. Nuria Plattner, bis 6/2020