HPLC-DAD-MS zur Metabolomik-Analyse

• Subject Area: Plant Sciences
• Term: Funded in 2014
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 260899359

Schwerpunkte unserer Arbeit sind die funktionelle Genomik und Metabolomik des Sekundärstoffstoffwechsels in sequenzierten Mikroorganismen, insbesondere in Pilzen der Ascomyzeten. Für die Produktion der gewünschten Substanzen, z.B. Arzneistoffe durch synthetische Biologie, sind Untersuchungen zur Biosynthese von Naturstoffen und Genfunktionen essentiell. Metabolomik hat sich in den letzten Jahren als erfolgversprechendes Verfahren zur Untersuchung des Sekundärstoffwechsels erwiesen. Um möglichst viele Metabolite aus Kulturen von Wildtyp und Transformanten unter diversen Bedingungen zu erfassen und damit Kenntnisse über Genfunktion und Genexpressionsprofile zu gewinnen, ist eine empfindliche und präzise Analyse-Methode erforderlich. Eine HPLC-Anlage gekoppelt mit einem Photodioden Array Detektor (DAD) und einem hochaufgelösten TOF-Massenspektrometer bietet ideale Voraussetzungen für diese Zwecke. Die Hochauflösung und Fragmentierung durch MSn-Experimente sind für die Identifizierung mancher Substanzen von entscheidender Bedeutung, da diese Substanzen häufig nur in sehr geringer Menge produziert werden und eine Strukturaufklärung mittels NMR-Analyse unmöglich wäre. Zusätzlich soll die beantragte Anlage zur Produktidentifizierung von Enzymassays eingesetzt werden.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Major Instrumentation: HPLC-DAD-MS zur Metabolomik-Analyse
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Applicant Institution: Philipps-Universität Marburg
• Leader: Professor Dr. Shu-Ming Li