Prädiktive Modellierung von Wirt-Pathogen-Interaktionen durch Rekonstruktion genregulatorischer Netzwerke (B03)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2013 bis 2017
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 210879364

Netzwerke der Genregulation werden rekonstruiert mit einem top down-Ansatz basierend auf der Analyse von Hochdurchsatzdaten, insbesondere Transkriptomdaten von Wirt und Pathogen, wobei Vorwissen z.B. über Informationen über Promotor-Sequenzen, integriert wird. Die so gewonnenen Netzwerk-Modelle sind Grundlage für eine verbesserte Diagnose und Therapie von Pilzinfektionen. Weiterhin wird der Einfluss von nicht-kodierenden RNAs auf die Wirt-Pathogen-Wechselwirkung untersucht.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 124: Pathogene Pilze und ihr menschlicher Wirt: Netzwerke der Interaktion
• Antragstellende Institution: Friedrich-Schiller-Universität Jena
• Mitantragstellende Institution: Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie e. V.; Hans-Knöll-Institut (HKI)
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professor Dr. Reinhard Guthke; Professorin Dr. Manja Marz; Dr. Ekaterina Shelest