Alternative Splicing - switching and conformational diversity (B08)

• Subject Area: Bioinformatics and Theoretical Biology
• Term: from 2012 to 2016
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 201302640

„Dieses Projekt analysiert Effekte von Spleißereignissen auf die Konformation und Funktion von diversen Proteinen und ihre Rolle in gen-regulatorischen, metabolischen und Signal-Übertragungs-Netzwerken. Umfassende bioinformatische Analysen von Spleiß-Strukturen und die detaillierte biochemische Charakterisierung interessanter Proteine aus dem SFB werden in Hinsicht auf strukturelle Schalter, konformationelle Diversität und Funktionsänderungen durchgeführt. Messungen mit Exonchips, Hochdurchsatz-Sequenzierung und quantitativer Massenspektrometrie komplementieren die strukturelle und funktionelle Charakterisierung von Isoformen auf zellulärer Ebene.“

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 1035: Control of Protein Function by Conformational Switching
• Applicant Institution: Technische Universität München (TUM)
• Co-Applicant Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Project Heads: Dr. Martin Haslbeck; Professor Dr. Ralf Zimmer