Kryo-Tripelresonanz-Probenkopf
Final Report Abstract
Der Einsatz des Kryoprobenkopfes hat wichtige Beiträge zu strukturellen und funktionellen Studien an verschiedenen Proteinen geleistet. Das dadurch deutlich erhöhte Signal-zu-Rausch-Verhältnis erlaubte uns, nicht nur gering konzentrierte Proben noch zu vermessen, sondern auch eine Vielzahl an Messungen in wesentlich kürzerer Zeit durchzuführen. Somit konnten Proteine mit geringer Löslichkeit und/oder verminderter Stabilität analysiert werden. Zudem ermöglichte die erhöhte Sensitivität des Kryoprobenkopfes einen größeren Probendurchsatz bei den Messungen, sodass über das GTPase-Projekt hinaus weitere Arbeiten initiiert werden konnten. So wurde u. a. die Wechselwirkung von Bisphenolderivaten insbesondere mit verschiedenen Isoformen der kleinen GTPase Ras eingehend charakterisiert. Darüber hinaus war es möglich, die molekulare Grundlage der Klasse III-Ligandenerkennung durch die PDZ3-Domäne der Protein-Tyrosin-Phosphatase PTPN13 im Detail aufzuklären. Schließlich konnte auch die Struktur in Lösung der Fibronektin Typ III-Domäne 14 mit atomarer Auflösung bestimmt und deren Heparininteraktion beschrieben werden.
Publications
- Allosteric Activation of GDP-Bound Ras Isoforms by Bisphenol Derivative Plasticisers. International Journal of Molecular Sciences (2018) 19(4), 1133
Schöpel M, Shkura O, Seidel J, Kock K, Zhong X, Löffek S, Helfrich I, Bachmann HS, Scherkenbeck J, Herrmann C, Stoll R
(See online at https://doi.org/10.3390/ijms19041133) - Molecular Basis of Class III Ligand Recognition by PDZ3 in Murine Protein Tyrosine Phosphatase PTPN13. Journal of Molecular Biology (2018) 430(21), 4275-4292
Heumann R, Erdmann KS, Stoll R
(See online at https://doi.org/10.1016/j.jmb.2018.08.023) - Structure in solution of fibronectin type III-domain 14 reveals its synergistic heparin binding site. Biochemistry (2018) 57(42), 6045-6049
Zhong X, Arnolds O, Krenczyk O, Gajewski J, Pütz S, Herrmann C, Stoll R
(See online at https://doi.org/10.1021/acs.biochem.8b00771)
