Transkriptionelle Regulierung der Osteoblastendifferenzierung

• Antragsteller: Professor Dr. Stefan Mundlos
• Fachliche Zuordnung: Orthopädie, Unfallchirurgie, rekonstruktive Chirurgie
• Förderung: Förderung von 2012 bis 2015
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 210848907

• Erstellungsjahr: 2015

Zusammenfassung der Projektergebnisse

Insgesamt konnte in dieser Arbeit gezeigt werden, dass Micro-RNAs eine wichtige Rolle in der Genregulation der Osteoblastendifferenzierung spielen. Ferner konnten wir eine direkte Beeinflussung des BMP-Signalweges durch spezifische Micro-RNAs nachweisen. Schließlich war es das Ziel, neue bioinformatische Verfahren zu entwickeln, mit denen die transkriptionelle Regulation bei der Zelldifferenzierung besser analysiert werden kann. Abweichend von dem ursprünglichen Plan hat sich unsere Arbeit hierbei auf eine Verbesserung des Peak-Calling bei der ChiP-seq-Methode konzentriert. Dies ist hervorgegangen aus der initialen Problemstellung.

Projektbezogene Publikationen (Auswahl)

• (2013) Distinct global shifts in genomic binding profiles of limb malformation-associated HOXD13 mutations. Genome Res. 23(12):2091-102
  Ibrahim DM, Hansen P, Rödelsperger C, Stiege AC, Doelken SC, Horn D, Jäger M, Janetzki C, Krawitz P, Leschik G, Wagner F, Scheuer T, Schmidt-von Kegler M, Seemann P, Timmermann B, Robinson PN, Mundlos S, Hecht J
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1101/gr.157610.113)
• (2015) Saturation analysis of ChIP-seq data for reproducible identification of binding peaks. Genome Res. 2015 Jul 10. pii: gr.189894.115 [Epub ahead of print]
  Hansen P, Hecht J, Ibrahim D, Krannich A, Truss M, Robinson PN
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1101/gr.189894.115)
• MiR-497~195 cluster microRNAs regulate osteoblast differentiation by targeting BMP signaling. J Bone Miner Res. 2015 May;30(5):796-808
  Grünhagen J, Bhushan R, Degenkolbe E, Jäger M, Knaus P, Mundlos S, Robinson PN, Ott CE
  (Siehe online unter https://doi.org/10.1002/jbmr.2412)