Hochleistungsflüssigkeitschromatographie-Anlage mit hochauflösendem Ionenfallen-Hybridmassenspektrometer
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Mithilfe des hochauflösendem Ionenfallen/Orbitrap Hybridmassenspektrometers konnten am Standort Düsseldorf verschiedene massenspektrometrische Methoden etabliert und erfolgreich angewendet werden. Hervorzuheben ist die Etablierung der markierungsfreie Massenspektrometrie mit deren Hilfe im Bereich der Sekretom- und Proteomanalyse umfangreich Studien durchgeführt und publiziert werden konnten. Basierend auf dieser Methode zur Quantifizierung von Proteinen konnte ebenfalls die Identifizierung von Protein- Interaktionspartnern erfolgreich etabliert werden. Auch wurde das angeschaffte hochauflösendem Hybridmassenspektrometers für die Analyse von posttranslationalen Modifikationen wie etwa Phosphorylierung, S-Glutathionylierung oder auch Acetylierung eingesetzt. Aufgrund der hohen Sensitivität und Massengenauigkeit des Geräts war es möglich Experimente mit geringsten Probenmengen hochzuverlässig und exakt durchzuführen.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- Glutaredoxin regulates vascular development by reversible glutathionylation of sirtuin 1. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Dec 10;110(50):20057-62
Bräutigam L, Jensen LD, Poschmann G, Nyström S, Bannenberg S, Dreij K, Lepka K, Prozorovski T, Montano SJ, Aktas O, Uhlén P, Stühler K, Cao Y, Holmgren A, Berndt C
(Siehe online unter https://doi.org/10.1073/pnas.1313753110) - Proteomic Profiling of Ex Vivo Expanded CD34- Positive Haematopoetic Cells Derived from Umbilical Cord Blood. Stem Cells Int. 2013;2013:245695
Falkenberg H, Radke TF, Kögler G, Stühler K
(Siehe online unter https://doi.org/10.1155/2013/245695) - The p90 ribosomal S6 kinase (RSK) inhibitor BI- D1870 prevents gamma irradiation-induced apoptosis and mediates senescence via RSK- and p53-independent accumulation of p21WAF1/CIP1. Cell Death Dis. 2013 Oct 17;4:e859
Neise D, Sohn D, Stefanski A, Goto H, Inagaki M, Wesselborg S, Budach W, Stühler K, Jänicke RU
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/cddis.2013.386) - Tra2-mediated recognition of HIV-1 5' splice site D3 as a key factor in the processing of vpr mRNA. J Virol. 2013 Mar;87(5):2721-34
Erkelenz S, Poschmann G, Theiss S, Stefanski A, Hillebrand F, Otte M, Stühler K, Schaal H
(Siehe online unter https://doi.org/10.1128/JVI.02756-12) - How stemlike are sphere cultures from long-term cancer cell lines? Lessons from mouse glioma models. J Neuropathol Exp Neurol. 2014 Nov;73(11):1062-77
Ahmad M, Frei K, Willscher E, Stefanski A, Kaulich K, Roth P, Stühler K, Reifenberger G, Binder H, Weller M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1097/NEN.0000000000000130) - Identification of novel adipokines differential regulated in C57BL/Ks and C57BL/6. Arch Physiol Biochem. 2014 Dec;120(5):208-15
Hartwig S, Goeddeke S, Poschmann G, Dicken HD, Jacob S, Nitzgen U, Passlack W, Stühler K, Ouwens DM, Al-Hasani H, Knebel B, Kotzka J, Lehr S
(Siehe online unter https://doi.org/10.3109/13813455.2014.970197) - Proteome-wide analysis reveals an ageassociated cellular phenotype of in situ aged human fibroblasts. Aging (Albany NY). 2014 Oct;6(10):856-78
Waldera-Lupa DM, Kalfalah F, Florea AM, Sass S, Kruse F, Rieder V, Tigges J, Fritsche E, Krutmann J, Busch H, Boerries M, Meyer HE, Boege F, Theis F, Reifenberger G, Stühler K
(Siehe online unter https://doi.org/10.18632/aging.100698) - Zebrafish heart development is regulated via glutaredoxin 2 dependent migration and survival of neural crest cells. Redox Biol. 2014 May 2;2:673-8
Berndt C, Poschmann G, Stühler K, Holmgren A, Bräutigam L
(Siehe online unter https://doi.org/10.1016/j.redox.2014.04.012) - Characterization of regenerative phenotype of unrestricted somatic stem cells from human umbilical cord blood by functional secretome analysis. Mol Cell Proteomics. 2015 Jul 16
Schira J, Falkenberg H, Hendricks M, Waldera-Lupa DM, Kogler G, Meyer HE, Muller HW, Stühler K
(Siehe online unter https://doi.org/10.1074/mcp.M115.049312) - Characterization of Skin Aging-Associated Secreted Proteins (SAASP) Produced by Dermal Fibroblasts Isolated from Intrinsically Aged Human Skin. J Invest Dermatol. 2015 Aug;135(8):1954-68
Waldera Lupa DM, Kalfalah F, Safferling K, Boukamp P, Poschmann G, Volpi E, Götz-Rösch C, Bernerd F, Haag L, Huebenthal U, Fritsche E, Boege F, Grabe N, Tigges J, Stühler K, Krutmann J
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/jid.2015.120)
