Integrierte webbasierte Forschungsinfrastruktur zur Speicherung und Bereitstellung quantitativer, zeitaufgelöster Daten im Laborkontext und für die Wissenschaftsöffentlichkeit

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2010 bis 2013
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 161165354

In diesem Antrag geht es um Literaturversorgungssysteme der besonderen Art, nämlich Datenbanken aufbereiteter experimenteller Daten, die in der Systembiologie ihre Verwendung finden. Zie! dieses Projektes ist es, eine digitale Forschungsinfrastruktur für mittels Immunblots gewonnene kinetische Daten aufzubauen. Das Vorhaben ist anfänglich von Biologen getrieben, die Werkzeuge für ihre Forschung brauchen. In der neu zu schaffenden integrierten Umgebung werden Experimentatoren die Möglichkeit haben, alle relevanten experimentellen Daten in einem von ihrer Arbeitsgruppe betriebenen Server für experimentelle Daten (MIAQIE) abzulegen. Auf diese Daten wird innerhalb von wissenschaftlichen Projekten zugegriffen. Um die Daten längetftistig für Kollegen verwendbar zu machen, bieten sich neben wissenschaftlichen Publikationen öffentlich zugängliche Datensammlungen an. MIAQIE-Nutzer sollen ihre Daten aufbereiten können und die Resultate einfach in die Datenbank SABIORK einspeisen. SABIO-RK enthält diese Daten in einem für Modellierer besonders nützlichen Format. Es entsteht so ein Kommunikationspfad zwischen Experiment und Theorie.

• DFG-Verfahren: Forschungsdaten und Software (Wiss. Literaturversorgung und Informationssysteme)
• Antragstellende Institution: Heidelberger Institut für Theoretische Studien (HITS)
• Mitantragstellende Institution: Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ); Forschungsschwerpunkt Zell- und Tumorbiologie; Abteilung Signaltransduktion und Wachstumskontrolle