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Projekt
Insertion of tetrapyrrole cofactors into cytochrome cd1 nitrite reductase
Antragstellerin
Professorin Dr. Gunhild Monika Layer
Fachliche Zuordnung
Biochemie
Förderung
Förderung von 2009 bis 2016
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 100799727
Die periplasmatische Cytochrom cd1 Nitritreduktase (NirS), die den zweiten Schritt der Denitrifikation katalysiert, enthält Häm c und Häm d1 als essentielle prosthetische Gruppen. Während das Häm c durch das Cytochrom c Maturationssystem in das Protein eingebaut wird, ist die Insertion des Häm d1 noch fast völlig unverstanden. In unserer Arbeitshypothese wird der letzte Schritt der Häm d1 Biosynthese von dem periplasmatischen Protein NirF katalysiert. Es wird vermutet, dass das periplasmatische, Häm d1 bindende Protein NirN den Kofaktor von NirF übernimmt und in NirS inseriert. Bisher konnten wir zeigen, dass es sich bei NirF um ein in der Membran verankertes Lipoprotein handelt, und dass die drei Proteine NirF, NirN und NirS miteinander interagieren. Im Rahmen dieses Projektes möchten wir den Transfer des Häm d1 von dem terminalen Biosyntheseenzym NirF auf das Häm d1 Bindeprotein NirN untersuchen sowie die Insertion des Häm d1 in NirS durch NirN. Zu diesen Untersuchungen gehören unter anderem (1) die detaillierte Analyse der Häm d1 Bindung in NirN und der daran beteiligten Aminosäuren, (2) die Untersuchung des Interaktionsnetzwerkes zwischen NirF, NirN und NirS sowie weiterer potentieller Partner, (3) die Charakterisierung der Rolle des Häm c in NirN für den Häm d1 Transfer und (4) die Kristallisierung und Strukturaufklärung von NirN und NirF.
DFG-Verfahren
Forschungsgruppen
