Computergestützte Analyse von linearen Interaktionsmotiven und globulären Proteinkontaktflächen in Effektorproteinen (A02)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2009 bis 2017
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 52732026

Wir werden lineare Interaktionsmotive in viralen Tegumentproteinen und Proteinen aus Helicobacter pylori untersuchen. Die entsprechenden Methoden sollen auch zur Untersuchung von bakteriellen Glykolipiden erweitert werden, die das zelluläre Protein Mincle binden. Eine Kombination aus Molekülmodellierung, Docking und Moleküldynamik-Simulationen soll zur Untersuchungen der HCMV Proteine pUL50-pUL53 und zur Vorhersage der Komplexstruktur von HCMV IE1 mit Wirtsproteinen des TRIM-Familie eingesetzt werden.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 796: Steuerungsmechanismen mikrobieller Effektoren in Wirtszellen
• Antragstellende Institution: Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Heinrich Sticht