Regulation of hepatitis C virus RNA synthesis by viral nonstructural proteins and an essential host factor

• Applicant: Professor Dr. Volker Lohmann
• Subject Area: Virology
• Term: from 2008 to 2015
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 75978335

Das Hepatitis C Virus (HCV) ist ein bedeutendes Humanpathogen, das in vielen infizierten Individuen zu einer chronischen Leberentzündung mit schweren Leberschäden führt. Trotz effizienter Zellkulturmodelle, die seit einigen Jahren verfügbar sind, liegen die Grundlagen der Regulation viraler Genomreplikation noch im Dunklen. Das Projekt will zum Verständnis der komplexen Mechanismen, die der Initiation der RNA Synthese zugrunde liegen, beitragen. An diesem Prozess sind eine Reihe von cis-aktiven Elementen und die viralen Nichtstrukturproteine NS3, NS5A und NS5B direkt beteiligt. Im Mittelpunkt der Analysen steht das HCV Isolat JFH1, das sich durch eine außerordentlich effiziente Initiation der RNA Synthese in Zellkultur auszeichnet, die vor allem auf seiner Polymerase beruht. Die besonderen Eigenschaften dieses Enzyms sollen anhand von Struktur-Funktionsanalysen untersucht werden und zum Verständnis der molekularen Grundlagen der RNA-Synthese beitragen. Außerdem soll mittels chimärer Virusgenome die Interaktion zwischen NS3, NS5A und NS5B mit den Signalsequenzen in der RNA kartiert werden. Darüber hinaus soll ein in vitro Rekonstitutionsmodell auf der Basis gereinigter viraler Proteine etabliert werden, welches das detaillierte Studium einzelner Schritte der Replikationsinitiation und der daran beteiligten Protein-Protein und Protein-RNA Interaktionen erlaubt.

• DFG Programme: Research Grants