Hybrid-FT-Massenspektrometer

• Subject Area: Basic Research in Biology and Medicine
• Term: Funded in 2008
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 63792379

Zur Beantragung steht ein Massenspektrometer der neuesten Generation, das mit einer HPLC-Kopplung versehen werden soll. Das beantragte Gerät - inklusive Zubehör - ist für eine zentrale Nutzung im Rahmen der Proteomanatytik des Proteom Centrums Tübingen (PCT) vorgesehen. Das Gerät erweitert den am PCT existierenden massenspektrometrischen Gerätepark deutlich hinsichtlich Kapazitätserhöhung der Analytik, wie auch in Bezug auf verbesserte Sensitivität und Messgenauigkeit. Das PCT wird als “Proteomics-Core-Facility“ die laufenden Kooperationen mit dem beantragten Gerät bearbeiten und so lokale, regionale, nationale und internationale Kooperationsprojekte bedienen.Die hohe Messgenauigkeit des beantragten Gerätes wird neben der generell erhöhten Identifizierungsquote unbekannter Proteine besonders die Analytik post-translationaler Proteinmodifikationen (PTMs) verbessern. Hier steht die Kartierung phosphorylierter Aminosäuren im Vordergrund, wie auch die Analytik der Vielfalt von Zuckerstrukturen, durch die Proteine modifiziert werden. Darüber hinaus wird durch die geplante Anschaffung die MS-basierte quantitative Analytik auf ein bisher am PCT nicht erreichtes Niveau gehoben. Hierfür sollen u. a. Peptid-Datenbanken erarbeitet werden, die sich für die Nutzung der “proteotypischen Peptid Analytik eignen.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Applicant Institution: Eberhard Karls Universität Tübingen
• Leader: Professor Dr. Alfred Nordheim