Interaktive Visualisierung und automatische Analyse metabolischer Netzwerke

• Applicant: Professor Dr. Michael Jünger
• Subject Area: Theoretical Computer Science
• Term: from 2004 to 2007
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5425715

Visualisierung und Analyse metabolischer Netzwerke ist in der letzten Zeit als wichtiges Forschungsthema erkannt worden. Aufgrund der intensiven Forschungstätigkeit in diesem Bereich der Biochemie nimmt der Detaillierungsgrad dieser Netze täglich zu. Existierende und in Entwicklung befindliche Systeme konzentrieren sich auf die statische Darstellung solcher Netze mit klassischen Graph Drawing Methoden oder einfachen ad-hoc Methoden. Solche Systeme können den tatsächlichen Anforderungen der Anwender aus mehreren Gründen nicht gerecht werden. Zum einen kann die Darstellung dieser Systeme nur schwer auf Änderungen in den Netzwerken reagieren und selten auf Benutzerwünsche bei der Darstellung Rücksicht nehmen. Zum anderen erfordert die Größe und Komplexität der Netze die Möglichkeit einer Fokussierung auf Teilaspekte ohne den Gesamtkontext aus dem Auge zu verlieren. In einer interdisziplinären Kooperation zwischen drei Forschergruppen mit den Kompetenzbereichen Graph Drawing, Informationsvisualisierung und Biochemie wollen wir ein Softwarewerkzeug zur interaktiven Visualisierung und Analyse metabolischer Netzwerke schaffen, das der dynamischen Natur solcher Netze gerecht wird und die Biochemiker bei ihren täglichen Analyseaufgaben effektiv unterstützt. Verschiedene Interaktionsmöglichkeiten sowie übersichtliche Layouts helfen dem Anwender, metabolische Netzwerke zu erforschen, sich in ihnen zurechtzufinden oder diese miteinander zu vergleichen.

• DFG Programme: Priority Programmes
• Subproject of: SPP 1126: Algorithmics of Large and Complex Networks