Determinanten für die Zugänglichkeit von Chromatin bei der Bindung von Transkriptionsfaktoren

• Antragsteller: Professor Dr. Gunnar Schotta
• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung ; Zellbiologie
• Förderung: Förderung seit 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 542519968

Die molekularen Mechanismen, die die Fähigkeit von Pioneer-Transkriptionsfaktoren (PTFs) zur Initiierung der Chromatinöffnung steuern, sind weitgehend unbekannt. Bei der Untersuchung des Pioneer-Transkriptionsfaktors Foxa2 stellten wir fest, dass nur die gleichzeitige Bindung mit anderen TFs wie Gata4 zu einer erhöhten Chromatinzugänglichkeit führt. Wir haben Tet2 nun als Modulator der Chromatinzugänglichkeit an kombinatorischen Foxa2/Gata4-Bindungsstellen identifiziert. Bemerkenswerterweise scheint die katalytische Aktivität von Tet2 für die Chromatinzugänglichkeit entbehrlich zu sein, was zu einer Erkundung seiner nicht-katalytischen Funktionen anregt. Unser Forschungsplan beinhaltet die Untersuchung des Einflusses von Tet2 auf Chromatinmodifikationen, die Bestimmung der Rekrutierung zu Foxa2/Gata4-Stellen und die Identifizierung entscheidender Tet2-Proteindomänen. Darüber hinaus streben wir danach, das Zusammenspiel zwischen Tet2 und anderen Proteinen an diesen Stellen aufzudecken, um Aufschluss über Förderer oder Unterdrücker der Chromatinzugänglichkeit zu erhalten. Chemische Inhibitoren und Knockout-Zelllinien werden eingesetzt, um verantwortliche Chromatinremodellierungskomplexe zu identifizieren. Zusammenfassend taucht unser Projekt tief in die komplexen molekularen Interaktionen ein, die die Chromatinöffnung durch PTFs vorantreiben, wobei die nicht-katalytischen Funktionen von Tet2 und seine Orchestrierung der Chromatinzugänglichkeit an spezifischen Bindungsstellen im Mittelpunkt stehen.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen