Structural mechanisms of chromatin transcription

• Applicant: Professor Dr. Patrick Cramer
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2004 to 2009
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5425043

Die zelluläre Maschinerie für die mRNA-Synthese arbeitet mit Proteinfaktoren zusammen, die die Transkription durch Chromatin steuern. Diese 'ChromatinTranskriptionsfaktoren' tragen signifikant zur Genregulation bei, und umfassen die Proteine Spt4/5, Spt6, den Paf-Komplex, die Chromatin-remodellierende ATPase Chdl, das Nukeosom-alterierende Protein FACT, sowie die Histon-Methyltransferasen Setl and Set2. Spt4/5 und der Paf-Komplex koppeln die Transkription mit Veränderungen der Chromatin-Struktur, da sie sowohl RNA-Polymerase 11 (Pol 11) binden, als auch mit Chdl, FACT, und Histon-Methyltransferasen interagieren. Mit diesem Antrag möchte ich die Struktur von Chromatin-Transkriptionsfaktoren und ihren funktionalen Komplexen aufklären. In den ersten drei Jahren wollen wir (i) die Kristallstruktur von Spt4/5 alleine und im Komplex mit Pol 11 bestimmen, (ii) die Aufreinigung von endogenem PafKomplex, der aus fünf Polypeptiden besteht, in großem Maßstab für die Nanoliter-Kristallisation etablieren und (iii) lösliche Varianten von Chdl und FACT zur Kristallisation und Rekonstitution von Komplexen mit Spt4/5 erhalten. Von diesen Arbeiten erwarte ich strukturelle Einsichten in die Mechanismen Transkriptions-gekoppelter Veränderungen der Chromatin-Struktur.

• DFG Programme: Research Grants