Gemom-weite Matrix-CGH-Analyse des klassischen Hodgkin Lymphoms

• Applicant: Professor Dr. Harald Stein
• Subject Area: Pathology
• Term: from 2003 to 2011
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5415327

Die genomische Analyse der Tumorzellen (Hodgkin und Reed-Sternberg [HRS]-Zellen) des klassischen Hodgkin Lymphoms (cHL) steht erst am Beginn. Untersuchungen mittels der klassischen Zytogenetik ergaben bisher wenig charakteristische Chromosomenveränderungen bzw. Hinweise auf pathogenetisch wichtige Gene. Erst durch den Einsatz molekular-zytogenetischer Verfahren, wie der Vergleichenden Genomischen Hybridisierung (CGH) in Kombination mit Mikrodissektion der HRS-Zellen und universeller genomischer Amplifikation konnten charakteristische Zugewinne und Verluste identifiziert werden, die auf eine Reihe wichtiger Kandidatengene (z. B. REL) schließen ließen. Es ist Ziel des vorliegenden Antrags, das Ausmaß der genomischen Veränderungen der HRS-Zellen detailliert zu charakterisieren und neue Imbalancen aufzudecken. Dies soll vor allem durch Einsatz des Matrix-CGH Verfahrens (100-fach höhere Auflösung als die CGH) unter Verwendung eines Genom-weiten DNA-Chips (3000 BAC Klone) erreicht werden. Die gewonnenen Daten werden mit RNA-Expressionsprofilen von Hodgkin-Zelllinien korreliert sowie mittels bioinformatischer Methoden auf Zusammenhänge mit klinischen Parametern untersucht. Identifizierte Kandidatengene werden hinsichtlich ihrer Häufigkeit, Spezifität und prognostischen Relevanz an einem großen Patientenkollektiv mittels Immunhistologie, in-situ Hybridisierung und FISH unter Verwendung von Gewebe-Mikroarrays (TMAs) getestet.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Person: Professor Dr. Michael Hummel