Zur Phylogenie der Anisoptera (Odonata): Sekundärstrukturen der 28S rRNA als integrativer Teil eines Substitutionsmodells und eine Charakterisierung von potentiellen SINE Kandidaten als phylogenetischer Marker
Final Report Abstract
Ziel des Projektes war die Integration von Metadaten in die phylogenetische Analyse. Zudem sollten Antworten auf ungelöste Fragen zu den Verwandtschaftsverhältnissen innerhalb der Anisoptera gefunden werden. Die Schwierigkeiten bei der Identifikation von SINE Elementen ließen aus Zeit- und Kostengründen leider keine weitere Untersuchungen in dieser Richtung zu. Mit der im Zuge dieses Projektes entstandenen Software RNAsalsa, ist es jedoch gelungen, erstmals automatisiert Sekundärstrukturen in die phylogenetische Analyse zu integrieren. RNAsalsa ermöglicht die Generierung individueller Sekundärstrukturen für die verwendeten rRNA Sequenzen und deren Berücksichtigung während der Alignierung und der Stammbaumrekonstruktion. Dies erlaubte neue Einsichten in die Phylogenie der Anisoptera und Libellulidae.
