Functional and mechanistic insights into protein biogenesis and co-translational protein folding

• Applicant: Professorin Dr. Elke Deuerling
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2003 to 2007
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5411587

Die Biosynthese von Proteinen am Ribosom ist unmittelbar mit nachfolgenden Prozessen, wie der Chaperon-assistierten Proteinfaltung oder dem SRP-vermittelten Proteintransport, gekoppelt. Das ribosomale Protein L23 vermittelt diese ko-translationalen Kopplungen. L23 sitzt am ribosomalen Ausgangstunnel für naszierende Polypeptide und dient als Bindestelle sowohl für das Ribosomen-assoziierte Chaperon Trigger Faktor (TF), als auch für den Targetingfaktor SRP. Ziel des beantragten Projekts ist es, funktionelle und mechanistische Einblicke in die Prinzipien der ko-translationalen Faltung und Zielsteuerung neusynthetisierter Proteine in Escherichia coli zu erlangen. Mittels Ribosomen-Mutanten Stämmen und Quervernetzunganalysen in vivo und in vitro soll zum einen geklärt werden, ob TF und SRP um die Bindung an L23 kompetitieren und inwiefern die Art der naszierenden Polypeptidkette die Interaktion dieser Faktoren mit dem Ribosom beeinflussen kann. Zum anderen soll, basierend auf der Beobachtung, dass sogenannte Effektorsequenzen innerhalb naszierenden Polypeptide durch Interaktion mit dem ribosomalen Tunnel einen transienten Arrest der Translation bewirken, untersucht werden, ob die ko-translationale Proteinfaltung durch diese Effektorsequenzen beeinflusst wird.

• DFG Programme: Research Grants