Regulatory network for the adaption of Bacillus subtilis to reduced oxygen tension and changes in pH

• Applicant: Dr. Elisabeth Härtig
• Subject Area: Metabolism, Biochemistry and Genetics of Microorganisms
• Term: from 2003 to 2010
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5403781

Das gram positive Modellbakterium Bacillus subtilis ist im Boden Sauerstoffmangel ausgesetzt. Bisher konnten wir mit Partnergruppen die anaerobe Fermentation, die Nitratatmung und die zugehörige Genexpressionskontrolle über die Regulatoren ResDE, Fnr und ArfM aufklären. Nun gilt es, die Analyse der ResDEkontrollierten Gene der Ribonukleotidreduktase und des neuen Zweikomponentenregulationssystems YclJK abzuschließen. Die ungewöhnliche Struktur und Funktion des Redoxregulators Fnr und die damit verbundene, unverstandene Regulation von Fermentationsgenen sollen geklärt werden. Die Regulons von YclJK, Fnr, ArfM, AlsR und der anaerob induzierten Regulatoren YxaL, YbyB und YcnK sollen mittels Genomics-Analysen definiert werden. Die Expressionskontrolle einiger so bestimmter Zielgene soll exemplarisch aufgeklärt werden. Die Verbindung zur Stress- und Sporulationsregulation ist zu unterschieden. Schließlich sollen mit genetischer Methodik die bisher völlig unbekannten Nitrat- und Nitritregulationssysteme identifiziert und charakterisiert werden. Gewonnene Daten sollen über die von uns entwickelte Datenbank PRODORIC mittels Bioinformatik zu einem neuartigen Regulationsnetzwerkmodell zusammengefaßt, dieses experimentell überprüft und so sukzessive verbessert werden.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Person: Professor Dr. Dieter Jahn