Project Details
Projekt
Evaluation of different models of nuclear architecture based on the quantitative optical analysis of compaction levels of functionally defined chromatin regions
Applicant
Professor Dr. Thomas Cremer
Subject Area
Biophysics
Term
from 2003 to 2010
Project identifier
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5392526
Das "CT-IC" Modell basiert auf der Evidenz für zwei Hauptkompartimente des Zellkerns: Ein Kompartiment wird durch Chromosomenterritorien (CT) und ihre Chromatinfaserfaltungen oder Domänen repräsentiert; das andere Kompartiment wird als Interchromatin-Kompartiment (IC) bezeichnet und enthält die makromolekularen (Vorläufer-) Komplexe ("Module") für Transkription, Splicing, DNA Replikation und Reparatur. Für aktive Gene postuliert das Modell eine "offene" Chromatinstruktur, die an den IC unmittelbar angrenzt oder in den IC hinausreichende Schleifen bildet; hierdurch wird die Zugänglichkeit von aktiven Genen für Transkriptions- und Splicingmodule im IC sichergestellt. Permanent inaktivierte Gene werden im Inneren von "geschlossenen" Chromatinstrukturen positioniert und werden infolgedessen unzugänglich für Transkriptionsmodule. In diesem Vorhaben soll unter Verwendung höchstauflösender, quantitativer optischer Analyseverfahren die Zugänglichkeit von "offenen" und "geschlossenen" Chromatinstrukturen für makromolekulare Komplexe von verschiedener Größe untersucht werden. Dabei sollen als "Modellkomplexe" fluoreszierende Teilchen ("beads") mit definierten Durchmessern von 15 Nanometern bis zu einigen hundert Nanometern verwendet werden, die inerte oder experimentell modifizierte Oberflächen besitzen.
DFG Programme
Priority Programmes
