Untersuchungen zu molekularen Mechanismen der Transfer RNA-Gen-gerichteten Integration des Retrotransposons TRE5-A im Genom von Dictyostelium discoideum

• Antragsteller: Professor Dr. Thomas Winckler
• Fachliche Zuordnung: Pharmazie
• Förderung: Förderung von 2002 bis 2011
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5386061

In dem hier beschriebenen wissenschaftlichen Vorhaben sollen verschiedene Aspekte der positionsspezifischen Integration bestimmter Retrotransposons vor tRNA-Genen im Genom von Dictyostelium discoideum untersucht werden. Grundlage der geplanten Arbeiten ist ein kürzlich etablierter in vivo-Test, der die gerichtete Integration in D. discoideum-Zellen aktiver Retrotransposons vor ein definiertes Ziel-tRNA-Gen darzustellen vermag. De novo-Integrationsereignisse können auf die Identität und Struktur der inserierten Elemente sowie auf kritische Insertionsparameter wie die Orientierung und den Abstand zum Ziel-tRNA-Gen hin untersucht werden. In weiterführenden Arbeiten soll definiert werden, welche DNA-Sequenzen des untersuchten Retrotransposons TRE5-A für die gerichtete Integration minimal benötigt werden. Hierzu werden Mini-TRE5-A-Elemente konstruiert und auf ihre Mobilität getestet. Außerdem soll versucht werden, durch Zufallsmutagenese des D. discoideum-Genoms Wirtsfaktoren zu identifizieren, die für die Retrotransposition des mobilen Elementes gebraucht werden.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen