Rasterkraftmikroskopische Charakterisierung von Proteinkomplexen der DNA-Reparatur
Final Report Abstract
Unsere Forschungsarbeiten konzentrierten sich vor allem auf die Wechselwirkung des humanen Einzelstrang-DNA-Bindungsproteins RPA mit geschädigter DNA. Wir konnten spezifische Komplexe von hRPA mit UV-geschädigter und Cisplatin-modifizierter DNA im AFM abbilden und Aussagen über die Topologie der DNA im Komplex erhalten. Die Daten zeigen, dass hRPA sich um geschädigte DNA herum windet. Für das archaeale Einzelstrang-DNA-Bindungsprotein SsoSSB konnte eine spezifische Bindung an ssDNA sichtbar gemacht werden, eine Bindung an geschädigte DNA war aber im AFM nicht feststellbar. Für das sequenzspezifische archaeale dsDNA-Bindungsprotein ORF80 ist es uns gelungen, die Bindung an zwei spezifische Bindungsstellen auf einem langen DNA-Fragment in hoher Auflösung abzubilden. Eine Längenverkürzung der gebundenen DNA war hier nicht feststellbar, so dass man von einer Bindung von ORF80 an linear ausgestreckte DNA ausgehen muss.
Publications
- Site-specific binding of the 9.5 Kilodalton DNA-Binding protein ORF80 visualized by Atomic Force Microscopy'. (2005) Biomacromolecules 6, 1252-1257
Lysetzka, M., Zettl, H., Oka, G., Lipps, G., Krauss, G. and Krausch, G.
- 'Characterization of SSoSSB, Sso1450, Sso2001 proteins and Analysis of CRISPR and cas Genes from Sulfolobus solfataricus P2'. Promotionsarbeit, Universität Bayreuth, 2008
Han Dong
