Analysis of fast evolving genes in the Drosophila genome

• Applicant: Professor Dr. Diethard Tautz
• Subject Area: Evolutionary Cell and Developmental Biology (Zoology)
• Term: from 2000 to 2010
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5269994

• Final Report Year: 2009

Final Report Abstract

Das Ziel dieses Projektes war es nun, eine umfassende Analyse von schnell evolvierenden Genen durchzuführen. Dabei sollten die Daten aus dem Drosophila Genomprojekt genutzt werden, um weitere Kandidatengene zu identifizieren. Dazu wurden EST Sequenzen einer ferner verwandten Art (D. yakuba) generiert und diese direkt mit den D. melanogaster Genom Sequenzen verglichen. Auf diese Weise gelang es uns eine grosse Datenbasis über schnell evolvierende Gene in Drosophila zu erhalten. Überraschenderweise fanden wir auf diese Art auch eine neue Klasse von Genen, die sogenannten konservierten Orphan Gene. Hier handelt es sich um Gene die nur innerhalb einer Linie (z.B. bei Dipteren vorkommen), dort aber ein ungewöhnlich hohes Konservierungsmuster zeigen. Es ist daher wahrscheinlich dass diese Gene eine besondere Rolle in der Evolution der entsprechenden Linie gespielt haben.

Publications

• (2003). An evolutionary analysis of orphan genes in Drosophila. Genome Research, 13, 2213-2219
  Domazet-Loso, T., Tautz, D.
  
• (2003). Evolution of orphan genes in Drosophila. Universität zu Köln
  Tomislav Domazet-Loso
  
• (2004). Correlated evolution of synonymous and nonsynonymous sites in Drosophila. Journal of Molecular Evolution, 59,771-779
  Marais, G., Domazet-Loso, T., Tautz, D., Charlesworth, B.