Sequence polymorphisms in the VNTR domain of the epithelical mucin MUC1

• Applicant: Professor Dr. Franz-Georg Hanisch
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2000 to 2003
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5257028

Vielfach wiederholte Peptidepitope des epithelialen Membranmucins MUC1 stellen einen glykosylierungsabhängigen Immuntarget in diagnostischen und therapeutischen Anti-Tumor-Strategien dar. Nach den Ergebnissen eigener Vorarbeit enthalten die als konserviert angesehenen Wiederholungseinheiten der MUC1-VNTR-Domäne eine Serie distinkter Aminosäureaustausche. Die Häufigkeit dieser Austausche und ihr nach bisherigen Erkenntnissen ausschließlich in Tumoren registriertes Auftreten haben zu der Annahme geführt, daß der diagnostischen Erfassung dieser und evtl. weiterer noch zu identifizierender Peptidvarianten prognostischer Wert zukommen könnte. Aus technischen Gründen bietet sich die Analyse dieser Varianten auf DNA-Ebene unter Einsatz eines PCR-ELISA-Verfahrens an. Es soll mit Hilfe geeigneter Detektionsprimer die Identität und relative Inzidenz einzelner Basenaustausche pro Wiederholungseinheit ermittelt und eine mögliche Assoziation bestimmter Sequenzpolymorphismen mit dem Auftreten epithelialer Tumoren aufgezeigt werden. Darüberhinaus sollen das Auftreten und die individuelle Organverteilung dieser VNTR-Varianten durch massenspektrometrische Analyse der Glykopeptidfragmente auf Proteinebene bestätigt werden.

• DFG Programme: Research Grants