Massenspektroskopische Identifikation und Sequenzierung funktioneller Proteome der Plastide

• Applicant: Professor Dr. Lutz Eichacker
• Subject Area: Plant Sciences
• Term: from 1999 to 2002
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5229528

Das hochdynamische Gesamtproteom der Plastiden Höherer Pflanzen soll mit dem Prinzip der vergleichenden Proteomanalyse funktioneller Einzelproteome dargestellt werden. Durch Isolation und Charakterisierung funktioneller Proteinkomplexe der Plastiden soll die massenspektroskopische Identifikation von Einzelproteinen und die Sequenzierung ausgewählter Peptide der funktionellen Einzelproteome ermöglicht werden. Dies soll es erlauben, die Sequenzinformation der identifizierten Einzelproteine und Proteinkomplexe in den stoffwechselphysiologischen Kontext der kompartimentierten Zelle zu setzen. Die Analyse wird mit drei funktionellen Proteinkomplexen der inneren Membransysteme der Plastide begonnen werden: Dem Apparat zur Proteinbiosynthese, zum Proteinexport und zur Proteinassemblierung. Die Untersuchung soll an Proplastiden, Etioplasten und Chloroplasten der Gerste (Hordeum vulgare L.) und Chloroplasten von (Arabidopsis thaliana L.) begonnen und an der Alge Chlamydomonas reinhardtii L. und dem Cyanobakterium Synechocystis 6803 fortgesetzt werden. Es ist das Ziel der geplanten Arbeiten, mit der vergleichenden Identifikation funktioneller Einzelproteome, die Erstellung einer funktionellen Gesamtproteomkarte der Plastiden Höherer Pflanzen zu ermöglichen.

• DFG Programme: Research Grants
• Major Instrumentation: MALDI TOF MS
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer