7-substituted 8-aza-7-desazapurines (Pyrazolo [3,4-d] pyrimidines) as substitute of purin bases in synthetic DNA

• Applicant: Professor Dr. Frank Seela
• Subject Area: Organic Molecular Chemistry - Synthesis and Characterisation
• Term: from 1999 to 2005
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5226764

Die Watson-Crick Basenerkennung ist von eminenter Bedeutung für die Diagnose genetischer und infektiöser Krankheiten, sowie anderer z. B. forensischer Untersuchungen, die auf dem Nachweis geringster DNA-Mengen beruhen. In diesem Zusammenhang ist die Stabilisierung von Watson-Crick Basenpaaren in OligonucleotidDuplexen, sowie die Markierung von DNA mit Reportergruppen an räumlich unproblematischer Position von großem Interesse. Das Projekt beschreibt die Entwicklung von DNA-Synthesebausteinen auf der Basis strukturell modifizierter Purin-Basen mit unveränderter Watson-Crick Flanke. Zu diesem Zweck werden Pyrazolo[3,4-d]pyrimidine (=8-Aza-7-desazapurine; im Antrag wird ausschließlich die Purin-Zählweise verwandt) mit 7-Substituenten versehen, in Nucleoside umgewandelt und danach in Phosphoramidite übergeführt. Diese Synthesebausteine finden Eingang in die Festphasensynthese, wodurch Oligonucleotide zugänglich werden, deren Purinbasen an jeder beliebigen Position durch 8-Aza7-desazapurine mit gewählten 7-Substituenten ausgetauscht sind. Die Stabilität der DNA-Duplexe wird nach Hybridisierung der Einzelstränge aus TmWerten bestimmt und mit der der PurinStammoligomere verglichen. Darüber hinaus sollten in 8-Aza-7desazapurine Seitenketten mit Reportergruppen eingeführt und diese als diagnostische Proben verwendet werden.

• DFG Programme: Research Grants
• International Connection: Sweden
• Participating Person: Professor Dr. Rudolf Rigler