Multifunktionale Chromatinfaktoren bei der Kontrolle der Genexpression und Zellkernarchitektur (P03)

• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung ; Zellbiologie
• Förderung: Förderung seit 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 469281184

Die Genexpression wird durch Transkriptionsfaktoren (TFs) initiiert, die Chromatin binden, bevor RNA-bindende Proteine (RBPs) mit naszierender RNA interagieren. Es gibt jedoch Beispiele für TFs, die auch RNA auf regulatorische Weise binden. Unklar bleibt, wie eine duale Assoziation mit RNA und DNA die Genexpression steuert. Um dies zu klären, werden wir die Seneszenz menschlicher Zellen als Modell zur Identifizierung und mechanistischen Untersuchung der Funktionen von Chromatin-bindenden TFs verwenden, die auch RBPs sind. Wir haben eine Liste von 66 TFs zusammengestellt, die auch RNA binden, in zwei Seneszenzmodellen reguliert werden und die RNA-Prozessierung sowie die 3D-Genomkonformation beeinflussen können. Von diesen Proteinen werden wir insbesondere HMGB2 und AHCTF1 untersuchen und genomeditierte Linien, die den akuten und kontrollierbaren Abbau des Faktors ermöglichen, mit Genomik, hochauflösender Bildgebung und funktionellen Assays analysieren, um ihre Rolle im Chromatin im Vergleich zu der auf RNA zu verstehen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1565: Molekulare Mechanismen und Vernetzung von Prozessen der Genexpression
• Antragstellende Institution: Georg-August-Universität Göttingen
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Argyris Papantonis