Entwicklung eines genetischen Werkzeugkastens für Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica zur Analyse von Funktion und Zusammenspiel seiner nativen SMC-Komplexe Smc-ScpAB und MukBEF

• Antragstellerin: Dr. Franziska Kemter
• Fachliche Zuordnung: Stoffwechselphysiologie, Biochemie und Genetik der Mikroorganismen
• Förderung: Förderung von 2020 bis 2022
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 442665864

SMC-Protein-Komplexe kondensieren Chromosomen durch Bindung an und Translokation entlang der DNA und sind somit ein essentieller Bestandteil der Kompaktierung der DNA einer Zelle. Die beiden wichtigsten SMC-Komplexe in Bakterien, Smc-ScpAB und MukBEF, komprimieren die DNA auf unterschiedliche Weise: Während Smc-ScpAB beide Chromosomenarme nebeneinander anordnet, kondensiert MukBEF jeden Chromosomenarm einzeln. Im Gegensatz zu allen anderen Bakterien, welche entweder über Smc-ScpAB oder MukBEF verfügen, enthalten Spezies der Gattung Aeromonas beide SMC-Komplexe. Dieses gemeinsame Vorkommen ermöglicht die Untersuchung der Funktions- und Rollenunterschiede von Smc-ScpAB und MukBEF im Bezug auf chromosomale Segregation und Konformation sowie ihre Koordination im selben System. Um diese Untersuchung in Aeromonas zu ermöglichen, werden genetische Werkzeuge wie Plasmide, induzierbare Promotoren sowie Techniken zur genetischen Modifizierung von Aeromonas benötigt. Ziel dieses Projektes ist es somit, einen genetischen Werkzeugkasten für Aeromonas salmonicida subsp. pectinolytica zu etablieren und Funktion und Zusammenspiel von Smc-ScpAB und MukBEF zu untersuchen.

• DFG-Verfahren: Forschungsstipendien
• Internationaler Bezug: Schweiz
• Gastgeber: Professor Dr. Stephan Gruber