Zelltypspezifische HCMV-Genexpression und ihre Folgen für das MHC-I Immunopeptidom

• Antragsteller: Professor Dr. Lars Dölken; Professor Dr. Florian Erhard
• Fachliche Zuordnung: Virologie ; Immunologie
• Förderung: Förderung seit 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 398367752

Systembiologische Ansätze haben Hunderte von offenen Leserahmen und Tausende von Transkriptionsinitiierungsstellen im Genom des humanen Zytomegalovirus (HCMV) aufgedeckt. Frühere Studien konzentrierten sich auf Fibroblasten als Modellsystem. Es gibt jedoch Hinweise darauf, dass sich die HCMV-Genexpression zwischen infizierten Zelltypen erheblich unterscheidet. Wir werden das zelltypspezifische HCMV-Transkriptom und -Translatom aufdecken und aufklären, wie HCMV zelluläre und virale Faktoren nutzt, um die virale Genexpression an die unterschiedlichen metabolischen und immunologischen Bedingungen in verschiedenen Zelltypen während der lytischen Infektion anzupassen. Wir werden die Hypothesen testen, dass die Umstellung von nicht-produktiver Transkription transienter RNAs auf produktive Transkription stabiler RNAs das zelltypspezifische und zeitabhängige Transkriptom von HCMV definiert und dass uORFs die Feinabstimmung der Translation von Proteinen übernehmen. Darüber hinaus werden wir mathematische Modelle zur Integration von Expressionsdaten und quantitativen MHC-I-Ligandom-Daten entwickeln, um zu untersuchen, wie die Kinetik der Genexpression mit der MHC-I-Peptidpräsentation sowohl für zelluläre als auch virale Antigene zusammenhängt. In Zusammenarbeit mit den anderen Mitgliedern unserer RU werden wir unsere Erkenntnisse nutzen, um neue Ziele für diagnostische, prophylaktische oder therapeutische Ansätze zur Bekämpfung von HCMV-Infektionen zu identifizieren und zu validieren.

• DFG-Verfahren: Forschungsgruppen
• Teilprojekt zu: FOR 2830: Fortschrittliche Konzepte in der zellulären Immunkontrolle von Zytomegalieviren