Mikroproteine von Haloferax volcanii, die zwei CPXCG Motive enthalten und wahrscheinlich Zinkfingerproteins aus einer Domäne darstellen.

• Antragsteller: Professor Dr. Jörg Soppa
• Fachliche Zuordnung: Stoffwechselphysiologie, Biochemie und Genetik der Mikroorganismen
• Förderung: Förderung seit 2017
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 379644526

Im Rahmen des Schwerpunktprogramms SPP2002 „Kleine Proteine in Prokaryoten“ wird ein Projekt verfolgt, dass sich auf kleine Proteine des halophilen Archaeons Haloferax volcanii konzentriert, die durch zwei C(P)XCG Motive gekennzeichnet sind und daher Zinkfingerproteine darstellen. In der ersten Antragsperiode hat die phänotypische Charakterisierung von 16 Deletionsmutanten die große biologische Signifikanz kleiner Zinkfingerproteine für Haloarchaea verdeutlicht. Ein Protein, HVO_2753, wurde im Detail charakterisiert, und seine Struktur wurde mittels NMR aufgeklärt.In der zweiten Antragsperiode wird die biologische Bedeutung kleiner Zinkfingerproteine durch die Erzeugung einer Bibliothek aus weiteren Deletionsmutanten untersucht werden. Ein neuer Ansatz namens „hidden thiol proteomics“ wird etabliert werden, und er wird zur parallelen Untersuchung der differentiellen Expression kleiner Zinkfingerproteine unter unterschiedlichen Umweltbedingungen eingesetzt werden. HVO_2753 und einige weitere ausgesuchte C(P)XCG-Proteine von hoher biologischer Bedeutung werden im Detail charakterisiert werden. So werden z.B. die Bedeutung einzelner Aminosäuren für die Proteinfunktion in vivo aufgeklärt werden, spezifische Interaktionspartner werden identifiziert werden, und es werden weitere Strukturstudien durchgeführt werden. Insgesamt wird das Projekt einen beispiellosen Einblick in die biologischen Funktionenen und molekularen Mechanismen kleiner Zinkfingerproteine in Haloarchaea generieren.

• DFG-Verfahren: Schwerpunktprogramme
• Teilprojekt zu: SPP 2002: Kleine Proteine in Prokaryoten, eine unbekannte Welt