Mitochondriale Gentranslokationen als phylogenetische Merkmale innerhalb der Peracariden (Arthropoda: Crustacea)

• Applicant: Privatdozent Dr. Lars Podsiadlowski
• Subject Area: Evolutionary Cell and Developmental Biology (Zoology)
• Term: from 2006 to 2009
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 31967797

• Final Report Year: 2009

Final Report Abstract

Die mitochondrialen Genome einer Reihe von Isopoden. sowie einiger Aussengruppenvertreter wurden ganz oder teilweise sequenziert. Neben sequenzbasierten phylogenetischen Analysen wurden Genreihenfolge, RNA-Sekundärstrukturen, sowie auffällige Veränderungen der Nukleotidfrequenzen (Reversion des strand bias) vergleichend analysiert. Es zeigt sich, das sowohl bei den Isopoda, wie auch bei den Amphipoda deutliche Veränderungen der Genreihenfolge auftreten, die phylogenetische Information aufweisen und nicht im Widerspruch zu den sequenzbasierten Analysen stehen. Änderungen der Sekundärstruktur von tRNAs und Änderungen der Nukleotidfrequenzen besitzen von Natur aus eine geringere Spezifität als Genreihenfolgeänderungen und können daher vermutlich nur auf niedrigem taxonomischen Niveau sinnvoll herangezogen werden.

Publications

• (2006). Mitochondrial genome rearrangements as phylogenetic markers in isopods. Graduiertentreffen Evol.biologie der DZG, Potsdam 2006
  Kilpert F
  
• (2006): The mitochondrial genome of Ligia oceanica (Crustacea: Isopoda) is characterized by a novel gene order and unusual control region features. BMC Genomics 7: 241 (18 pp.)
  Kilpert F, Podsiadlowski L
  
• (2007). Gene arrangements and other phylogenetic markers of isopod mitochondrial genomes. DZG-Tagung, Köln. 21.-24.09.2007
  Kilpert F, Podsiadlowski L
  
• (2007). Gene arrangements and other phylogenetic markers of isopod mitochondrial genomes. GFBS-Tagung, Wien. 20.-23.2.2007
  Kilpert F, Podsiadlowski L
  
• (2008). Characters of mitochondrial genome organization in Isopoda. Advances in Crustacean Phylogenetics, Rostock, 7.-11.10.2008
  Kilpert F, Podsiadlowski L
  
• (2008). Mitochondrial genome morphology and the phylogeny of isopods. Systematics 2008, Göttingen. 7.-11.4.2008
  Kilpert F, Podsiadlowski L
  
• (2009). Isopod mitogenomics: Phylogenetic inferences from sequence analyses and "genome morphology". 14th German Crustacean Conference. Rostock, 2.-5.04.2009
  Kilpert F, Wilson G D F, Podsiadlowski L