Analyse der Funktion des Arabidopsis Proteins SERRATE bei der Transkription und dem Spleißen.

• Antragsteller: Professor Dr. Sascha Laubinger
• Fachliche Zuordnung: Genetik und Genomik der Pflanzen ; Pflanzenphysiologie
• Förderung: Förderung seit 2015
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 276820861

Die Expression von Genen kann auf verschiedenen Ebenen kontrolliert werden, wie zum Beispiel der Transkription, der RNA-Prozessierung oder der Translation. Das essentielle SERRATE (SE) Protein aus Arabidopsis thaliana ist ein wichtiger Regulator der Genexpression. Das SE-Protein agiert dabei als Gerüstprotein indem es Interaktionen mit anderen Proteinen und RNAs vermittelt. SE fördert u.a. die Transkription indem es direkt an das Chromatin seiner Zielgene bindet. Auf der Ebene der RNA-Prozessierung fördert SE die mikroRNA-Prozessierung, das Spleißen von Introns aus mRNAs und SE reguliert die RNA-Stabilität. Darüber hinaus ist das SE-Homolog aus Metazoen, ARS2, in der Lage, die RNA 3'End-Prozessierung zu fördern und den RNA-Transport von mRNAs aus dem Zellkern zu regulieren. In diesem Projektantrag fokussieren wir uns auf zwei verschiedene Funktionen von SE bei der Regulierung der Genexpression: 1) Während die Funktion von SE bei der Förderung der Transkription bereits beschrieben wurde, zeigen unsere Ergebnisse, dass SE die Transkription auch hemmen kann. Ziel unseres Projektantrages ist es, den noch unbekannten Mechanismus der SE-abhängigen Hemmung der Transkription zu untersuchen.2) SE bildet Komplexe mit dem U1 snRNP, einer Untereinheit des Spleißosoms. Unsere Daten aber suggerieren, dass diese Interaktion für die Funktion von SE beim Spleißen entbehrlich ist. Wir werden daher alternative Funktionen der Interaktion zwischen SE und dem U1 snRNP untersuchen, die eine wichtige Rolle bei der Regulation von Genexpression in Pflanzen spielen.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen