Molekulare Simulationen von RNA-Faltung und Funktion (A09)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung von 2015 bis 2023
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 161793742

In der biophysikalischen Beschreibung von RNA gewinnt die Erforschung des Zusammenhangs von Struktur, Dynamik und Funktion in vivo zunehmend an Bedeutung. Jüngste Experimente zeigten eine unerwartete Strukturausbildung im RNA Transkriptom, die auf regulative Aufgaben wie beispielsweise die Kontrolle des Spleißens hinweist. Unser Projekt zielt darauf hin, eine Brücke zwischen Sekundärstrukturvorhersagen und hochauflösenden Strukturdaten an RNA zu schlagen, indem wir extensive einzelsträngige RNA-Ensembles über MM (molecular mechanics) und MD (molecular simulations) mit NMR-, EPR- und Fluoreszenzspektroskopischen Experimenten verknüpfen. Wir werden das Spleißsystem SM2, das auch experimentell charakterisiert wurde, durch Kombination strukturierter und unstrukturierter Elemente untersuchen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 902: Molekulare Mechanismen der RNA-basierten Regulation
• Antragstellende Institution: Goethe-Universität Frankfurt am Main
• Mitantragstellende Institution: Max-Planck-Institut für Biophysik
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Gerhard Hummer