Triple Quadrupol LC-MS/MS System

• Subject Area: Plant Sciences
• Term: Funded in 2014
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 260056257

In der Gruppe von Prof. Björn Usadel werden experimentell die Synthese und der Abbau der pflanzlichen Zellwand, der Zuckerstatus der pflanzlichen Zelle, sowie der Zusammenhang zwischen Primärmetabolismus und Zellwandbiosynthese untersucht. Die Quantifizierung von Metaboliten und Metabolit-Flüssen ist essentiell notwendig, um Änderungen im Stoffwechsel zu detektieren und bestimmte Stoffwechselwege tiefergehend analysieren zu können. Insbesondere Nukleotidzucker und Zuckerintermediate, als Vorläufer von Zellwand- Polysacchariden und deren Metabolismus sind von besonderer Bedeutung für den Zellwandstoffwechsel. Für diese anspruchsvolle Analytik wird ein Triple Quadrupol LC-MS/MS System beantragt, das die sensitive, spezifische Detektion und Quantifizierung diverser Spektren an Primärmetaboliten wie z.B. Zuckerphosphate aber auch spezifische Metabolite wie die Nukleotidzucker mittels etablierter Methoden ermöglicht. Zudem können Flüsse von 13C-markierten Metaboliten mit Hilfe dieses Gerätes bestimmt werden. Das System ist weiterhin für quantitative Proteinananalysen mittels multiple reaction monitoring ('Mass Western') geeignet und wird somit das Transkriptomics- und Metabolomics-Spektrum der Gruppe um gezielte Proteomics-Ansätze erweitern. Es bietet so auch zusätzliche Anwendungsmöglichkeiten für andere Arbeitsgruppen.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Major Instrumentation: Triple Quadrupol LC-MS/MS System
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Applicant Institution: Rheinisch-Westfälische Technische Hochschule Aachen
• Leader: Professor Dr. Björn Usadel